文章核心观点 PacBio宣布一项发表于《自然通讯》的研究，该研究利用Paraphase和HiFi长读长测序技术，实现对人类基因组中复杂区域的高精度分析，填补基因组研究空白，为疾病研究等提供新机会 [1][3][4] 研究背景 - 节段性重复区域基因对人类健康至关重要，但因序列高度相似，短读长测序难以准确绘制图谱和检测变异 [2] 研究方法 - 研究由PacBio、GeneDx和全球基因组学专家组成的团队开展，利用Paraphase信息学工具结合HiFi长读长测序技术，对316个此前难以分析的节段性重复区域进行高精度变异检测和拷贝数分析 [1][2] 研究发现 揭示基因组此前难以触及区域 - 研究对跨越316个基因的160个长节段性重复区域应用Paraphase，揭示五个祖先群体的遗传变异新见解 [3] - Paraphase可解决长期以来需要专门多步检测的医学重要基因家族分析难题，如在CYP21A2/CYP21A1P区域发现可能导致标准测试误分类的重复等位基因 [3] 新发现的新发变异 - 对36个亲子三人组的分析发现7个此前未检测到的新发单核苷酸变异和4个新发基因转换事件，其中2个为非等位基因，传统测序方法难以达到此细节水平 [5] 不同群体的拷贝数变异性 - 研究分析了不同群体中旁系同源基因的拷贝数分布，显示许多节段性重复区域基因家族的拷贝数变异性高，并提供识别参考基因组中假重复的新方法 [5] 基因转换驱动基因与旁系同源基因的序列相似性 - 研究团队确定23个旁系同源基因组，基因与旁系同源基因之间遗传多样性极低，表明频繁的基因转换和/或不等交换可能在保留高度相似基因拷贝中发挥作用 [5] 专家观点 - PacBio生物信息学副总裁Michael A. Eberle博士表示，Paraphase和HiFi测序为不同人群中SD编码基因准确分型提供可扩展方法，填补基因组研究空白，提高识别疾病相关变异的能力 [3] - 研究主要作者、PacBio首席科学家Xiao Chen博士称，HiFi测序呈现更丰富复杂的遗传变异图景，Paraphase能精确解析此前难以触及的遗传区域，为疾病研究等提供新机会 [4] - GeneDx首席医疗官Paul Kruszka博士认为，长读长基因组测序可检测其他方法难以识别的变异，该研究可能增强变异检测能力，解决复杂基因组区域问题，为患者和家庭提供更多答案 [4] 公司介绍 - PacBio是领先的生命科学技术公司，设计、开发和制造先进测序解决方案，产品基于HiFi长读长测序和SBB短读长测序两项核心技术，应用于人类生殖系测序等多个研究领域 [6]