文章核心观点 - 麻省理工学院和Recursion公司联合发布开源生物分子基础模型Boltz - 2，该模型在联合建模复杂结构和结合亲和力方面达到一流精度，能加速药物发现 [1][2] 模型介绍 - Boltz - 2是首个结合结构和结合亲和力预测的生物分子共折叠模型，在标准基准测试中接近基于物理的自由能微扰（FEP）的准确性，速度快达1000倍 [5] - 模型由麻省理工学院Boltz团队在Regina Barzilay和Tommi Jaakkola教授监督下，联合麻省理工学院和Recursion的研究人员开发，将根据MIT许可进行开源，供学术和商业使用 [4] 模型优势 - 提高亲和力预测：在FEP + 基准测试中接近FEP准确性，速度快超1000倍且计算成本低 [6] - 领先基准性能：在CASP16亲和力挑战中表现优于所有参与者 [6] - 先进联合建模：独特地对3D复杂结构建模，同时预测结合亲和力和蛋白质动力学 [6] - 可控且符合物理现实：使用Boltz - 转向显著提高物理合理性，通过模板、方法和接触条件增强用户控制 [6] - 新颖且扩展的训练数据：基于分子动力学模拟、扩展蒸馏数据和约500万次结合亲和力测定测量进行训练 [6] 模型意义 - 解决药物发现中准确预测分子结合强度的长期挑战，帮助科学家发现新生物学见解 [2] - 使大规模准确虚拟筛选更实用，解决小分子发现的关键瓶颈 [2] - 为研发团队提供有效分诊工具，助力聚焦最有前景的化合物，推动药物研发领域发展 [3] 关于Recursion公司 - 临床阶段的TechBio公司，通过解码生物学改善生活，拥有Recursion OS平台，生成全球最大的生物和化学数据集之一 [7] - 利用机器学习算法从数据集中提取数万亿生物和化学关系，每周可进行数百万次湿实验室实验，拥有并运营强大超级计算机 [7] - 总部位于盐湖城，是BioHive创始成员，在多地设有办公室，可通过官网、X和LinkedIn了解更多信息 [8]