LENZ Therapeutics, Inc.(LENZ) - 2022 Q4 - Annual Report

基因编辑平台技术与效率 - 公司基因编辑平台在造血干细胞中实现高达约70%的基因校正效率[16] - 在基因替换和靶向基因插入应用中,造血干细胞效率达到约30%至50%[16] - 公司技术可替换长达4千碱基对的基因,以纠正点突变、多重突变及基因缺失[16] - 在符合IND标准的GMP生产条件下,公司能精确纠正超过55%的治疗细胞中的SCD突变[20] - 在靶向CCR5等位基因的HSPC中,GPH301实现了约35%的基因插入率,导致约50%的细胞至少有一个等位基因被靶向[22] - 下一代基因编辑技术实现高达约70%的靶向基因整合效率,在人类造血干/祖细胞(HSPCs)的体外研究中,基因校正频率从最初实验的约20%优化至约70%[41][44] - 在基因替换和靶向基因插入应用中,公司技术在HSPCs中针对一系列基因靶点和模板持续展示约30%-50%的效率[44] - 该技术平台能够替换长达4 kb的基因,并可插入长达4 kb的新DNA序列[44] - 在开发此基因整合平台之前,利用HDR在HSPCs中的效率约为10%[44] - 公司的方法旨在避免整合病毒载体带来的插入性肿瘤发生理论风险,并采用高保真CRISPR核酸酶[44] - 在GMP生产条件下,公司基因疗法nula-cel对超过55%的HSPCs实现了基因校正[63] - 临床前数据显示,nula-cel在SCD患者来源的HSPCs中校正了超过60%的HbS等位基因[68] - 经nula-cel处理的细胞在体外分化后,正常血红蛋白A表达超过90%,镰状血红蛋白仅约10%[69] - 在免疫缺陷小鼠模型中,移植后长期HSCs的基因校正率约为30%,等位基因校正率约为40%[69] - 在Townes小鼠模型中,基因校正率超过15%的小鼠显示出超过55%的HgbA表达,红细胞半衰期延长约十倍[70][72] - GPH201在临床前研究中,健康供体来源的HSPCs中IL2RG基因替换效率平均约为45%[75] - GPH201在免疫缺陷小鼠体内移植后观察到约30%的基因替换[75] - GPH301临床前研究中,约35%的靶向CCR5等位基因成功插入GCase基因[79] - 在MPS I研究中,约45%的靶向CCR5等位基因包含PGK-IDUA插入[83] - 临床前研究中HBB基因插入HBA1位点的效率约为40%[84] - 公司基因编辑平台在体外研究中实现HSPC靶向基因整合效率高达约70%[44] - 相比传统HDR方法在HSPC中约10%的效率,公司平台效率显著提升[44] - HiFi Cas9相比野生型Cas9平均减少脱靶DNA切割高达20倍,针对SCD基因可减少30倍[45] - 通过细胞因子预刺激和四次循环,HSC基因整合率提高约一倍[51] - 将HSC铺板密度降低10倍,基因整合率提高近一倍[51] - 公司主要候选产品nula-cel的基因校正效率在临床前研究中达到约70%[16] - 在基因替换和靶向基因插入应用中,公司临床前研究显示效率约为30%至50%[16] - 公司技术可将长达4千碱基对的基因替换,以校正单点突变、同一基因内的多重突变及基因缺失[16] - 公司已实现超过预期治愈阈值的基因整合效率,并在多种疾病模型中展示临床前概念验证[14] - 在符合IND的GMP生产条件下,公司能精确校正超过55%的治疗细胞中的SCD突变[20] - 公司优化后的基因校正频率从最初实验的约20%提升至约70%[41] - 公司的高保真Cas9在临床前模型中平均将脱靶切割降低了20倍[38] - 针对镰状细胞病基因,高保真Cas9在临床前模型中平均将脱靶切割降低了30倍[38] - 同源定向修复模板包含长达4 kb的新DNA序列[36] - 公司使用非整合性AAV6病毒载体递送优化的合成DNA模板[40] 临床前研究与疾病模型数据 - 公司预计纠正细胞植入率达到20%即可治愈患者[20] - 在SCD小鼠模型中,基因纠正将红细胞寿命从2天延长至19天[20] - 估计仅需1-5%的基因校正HSCs即可重建XSCID患者的免疫力[78] - GPH301编辑移植的细胞中插入等位基因超过10%,对应超过15%的细胞,高于5%-10%的预测治愈阈值[79] - 在MPS I研究中,编辑移植的细胞中插入等位基因超过5%,对应约7%的细胞[83] - 在MPS I临床前模型中,携带PGK-IDUA基因插入的细胞IDUA酶活性比健康供体高约30倍[83] - 每日红细胞生成量高达2000亿个[84] - 每个红细胞含有2.8亿个血红蛋白分子[84] - 靶向基因插入方法可实现低于10%的HSC植入目标[84] - 公司基因校正方法在小鼠SCD模型中显著增加正常HgbA表达,并将红细胞寿命从2天延长至19天[20] - 估计需要20%的校正细胞植入率才能治愈患者[43] - 长期观察显示仅20%的HSC具有正常血红蛋白即可实现治愈[63] - 临床获益在低至5%的校正细胞水平下即可观察到[63] - 纠正两个镰状球蛋白基因中的一个即可足够校正细胞[63] - 目标是用基因校正细胞替换患者足够数量的HSC以治愈SCD[62] 产品候选物与临床开发状态 - 公司目前无处于积极临床开发阶段的产品候选物[10] - 公司已暂停其针对镰状细胞病的nula-cel的1/2期CEDAR研究,并决定停止该候选产品的开发[18][26] - 公司决定停止开发使用与nula-cel相同基因编辑平台技术的基因替代项目(包括GPH102和GPH201)和靶向基因插入项目[21][22] - 公司将继续研究与早期非基因毒性预处理项目相关的活动[26] - 公司的主导产品候选物nula-cel(用于治疗镰状细胞病SCD)的1/2期CEDAR研究因首例给药患者出现严重不良事件而自愿暂停,并于2023年2月决定停止开发[56] - nula-cel 1/2期临床试验因首例患者出现严重不良事件而自愿暂停并于2023年2月决定终止开发[73] - 公司已暂停nula-cel的1/2期CEDAR研究,并因严重不良事件决定停止其开发[18] - 公司宣布停止nula-cel开发,并启动探索战略替代方案的程序[26] - nula-cel是首个旨在精确纠正致病基因的靶向基因疗法[60] 技术优势与创新 - 高保真Cas9酶在临床前模型中平均减少脱靶切割20倍,对于SCD基因平均减少30倍,而对靶向切割率无显著影响[38][45] - AAV6血清型在十种AAV血清型中对人类原代造血祖细胞的转导效率最高[48] - 通过细胞因子预刺激和四次循环,造血干细胞(HSCs)的基因整合率提高约一倍;将细胞铺板密度降低10倍,基因整合率提高近一倍[51] - 当前基于CRISPR-Cas9的基因编辑方法主要依赖NHEJ途径,其效率远超HDR,导致无法高效进行精确基因纠正[32] - 碱基编辑技术目前仅能纠正六种潜在核苷酸改变中的两种,无法实现将腺嘌呤(A)转换为胸腺嘧啶(T),因此不能纠正导致SCD的突变[35] - nula-cel旨在将SCD基因型(HbSS)转化为正常基因型[60] - 该方法通过纠正致病突变克服当前基因添加方法的局限性[60] 市场竞争与竞争对手 - 公司面临基因编辑领域激烈的竞争和快速技术变革[10] - 竞争对手包括Beam Therapeutics、bluebird bio等9家基因编辑/治疗公司[92] 知识产权与专利 - 公司拥有2项美国待批专利申请、2项PCT申请及5项临时专利申请[93] - 首个专利家族预计于2042年到期(不含延期)[93] - 第二个专利家族预计于2042年到期(不含延期)[93] - NGTC项目相关专利预计于2043年到期(不含延期)[93] - 公司从IDT获得许可的专利和专利申请,在支付维护费的前提下,预计于2037年到期[102] 合作协议与许可安排 - 公司向斯坦福大学支付了5万美元的预付款并发行了约60万股普通股以获得独家许可[96] - 公司为获得独家许可、专利权和技术诀窍支付的总对价为280万美元[96] - 公司向斯坦福大学支付的年度许可维护费初始为5000美元,将在协议生效后七年内分三次增至5万美元[96] - 首个许可产品商业化后,年度许可维护费将变为20万美元[96] - 公司需就每个许可产品向斯坦福大学支付最高达1280万美元的里程碑款项[96] - 公司需向斯坦福大学支付基于许可产品全球年净销售额的低个位数百分比特许权使用费[96] - 公司与药明康德签订了为期五年的主开发与制造服务协议[96] - 第二份期权协议下,公司同意向斯坦福大学支付总计3万美元的期权费[100] - 第二份期权协议的维护费为1万美元,已在截至2022年6月30日的六个月期间支付[101] - 第一份期权协议下,若公司行使期权需向斯坦福大学授予132,137股普通股并支付1万美元许可执行费[99] - 公司与Integrated DNA Technologies, Inc. (IDT) 签订许可协议,支付300万美元首付款[102] - 公司有权通过支付每个领域50万美元或两个领域共100万美元的费用,将许可范围扩展至β地中海贫血和溶酶体贮积症[102] - 公司需向IDT支付总计最高530万美元的监管里程碑款项,若扩展两个领域则总额增至880万美元[102] - 公司同意向IDT支付产品净销售额的低个位数百分比作为特许权使用费[102] - 截至2022年12月31日及2021年12月31日,公司尚未达成任何监管里程碑,仅支付了300万美元首付款[102] 监管审批流程与要求 - 生物制品在美国上市前必须通过FDA的生物制品许可申请(BLA)流程批准[105] - FDA需在收到BLA后60天内决定是否受理申请进行审查[105] - 新药临床试验申请(IND)在FDA收到后30天自动生效,除非FDA因安全问题提出质疑[106] - 通常需要两项充分的、对照良好的3期临床试验才能获得BLA批准[107] - BLA提交后FDA有60天决定受理或拒绝申请[109] - FDA标准审批目标为10个月优先审批目标为6个月[109] - BLA申请需支付显著的用户费用具体金额每年调整[109] - 罕见儿科疾病定义在美国患者少于200,000人[114][116] - 孤儿药认定可获得7年市场独占期[114] - 快速通道和突破性疗法认定FDA需在60天内决定[112] - 儿科研究可获得额外6个月市场独占期[115] - 加速批准可能要求批准前或批准后特定时间内启动验证性试验[112][113] - 加速批准后需每180天向FDA提交研究进展更新[113] - 再生医学先进疗法(RMAT)可基于替代终点获得加速批准[112] - 罕见儿科疾病优先审评券计划延长至2024年9月30日,潜在授予期至2026年9月30日[118] - 生物制品获批后需遵守cGMP,并面临FDA的周期性突击检查[119] - 生物制品上市后变更需经FDA事先审查和批准[119] - FDA可因合规问题撤销产品批准,并处以罚款、警告信或暂停临床试验等处罚[119] - 美国专利期限恢复最长可达5年,但专利剩余总期限自产品批准日起不得超过14年[121] - 生物类似药申请可在参照产品首次获FDA许可4年后提交,批准生效需等待12年独占期[122] - 欧洲集中审批程序评估营销授权申请最长时间为210天,加速评估可缩短至150天[126] - 欧盟创新药物享有8年数据独占期和2年市场独占期,总计最长可达11年[127] - 欧洲临床试验新规过渡期至2025年1月31日,采用单一入口和协调评估程序[125] - 英国脱欧后,药品监管至2024年1月1日将实施新的国际认可框架[126] - 欧盟孤儿药认定标准为患病率不超过5/10,000人或预期收益不足以证明开发投资合理性[128] - 欧盟孤儿药认定可获得10年市场独占权,若第5年底不符合标准可能减至6年[128] - 欧盟药品上市后需遵守药物警戒、GMP生产和营销推广等严格监管要求[128] - 英国脱欧后通过《贸易与合作协定》但未实现药品法规全面互认[131] - 英国药品和保健品监管局将从2024年1月1日起考虑EMA等机构审批决定[131] 市场疾病流行病学与需求 - 全球镰状细胞病(SCD)年新增病例超过30万例,美国约有10万患者,欧盟另有6.7万患者[58] - 全球SCD患病率估计约为2000万至2500万人,携带者超过1亿人[58] - 患者预期寿命减少20-30年[58] - 异体造血干细胞移植(Allo-HSCT)治愈性疗法中,匹配供体寻找成功率低至16%-19%[59] - 美国每年进行超过150例Allo-HSCT手术,但约90%的非裔美国人没有匹配的同胞供体[59] - 美国约有6,000名戈谢病患者,其中90%在美国和欧洲被归类为1型[78] - 美国约有6万人患有α-1抗胰蛋白酶缺乏症[86] - 镰状细胞病全球年新发病例估计超过30万,美国患者约10万人,欧盟约6.7万人[58] - 异基因HSCT治疗SCD时,仅16%-19%的患者能找到匹配供体[59] 公司财务状况与运营风险 - 公司尚未从产品销售中产生收入,且可能永远无法盈利[10] - 公司需要大量额外资金,若无法筹集将被迫延迟、缩减或终止研发项目[10] - 公司自成立以来持续产生重大亏损,预计未来将继续亏损且可能无法实现或维持盈利[10] - 公司需要大量额外资金,若无法获得可接受条款的融资,将被迫延迟、缩减或终止研发项目[10] 公司重组与裁员 - 公司于2023年2月宣布重组和裁员,但可能无法实现预期目标[10] - 公司宣布将裁员约50%[26] - 公司于2023年2月宣布了一项重组计划,涉及裁员约50%[139] - 公司重组将导致约50%的人员裁减[26] 第三方依赖与供应链风险 - 公司依赖第三方生产研究材料和临床候选物,存在供应不足或质量风险[11] - 公司面临与第三方制造商相关的风险,可能影响材料供应质量、成本或时间线[11] 外部环境风险 - 公司业务受到COVID-19大流行等健康流行病的影响[11] 患者治疗风险与挑战 - 患者需要经过非靶向、基因毒性的预处理,这会带来安全性风险,如短暂中性粒细胞减少症、潜在生育能力损伤和继发性恶性肿瘤风险[53] 医疗政策与支付环境 - 根据《2011年预算控制法》,向医疗服务提供者支付的医疗保险款项每个财年整体减少2%,该政策将持续至2031年[137] - 根据《2022年通胀削减法案》,从2025年开始,D部分医疗保险受益人的自付费用上限将从7,050美元降至2,000美元[138] - 美国药品净价格受政府强制性折扣和进口政策放松影响可能降低[132] - 第三方支付方可能将药品覆盖范围限制在特定目录内影响产品市场准入[132] 法律与合规风险 - 违反美国《虚假申报法案》可能导致每项虚假索赔三倍罚款和重大经济处罚[135] - 美国《反回扣条例》禁止为诱导联邦医疗计划业务支付报酬的行为[135] - HIPAA法规对个人健康信息的隐私、安全和传输施加严格要求[135] 公司基本信息与员工情况 - 公司于2022年12月31日拥有120名全职员工,其中34名拥有博士或医学博士学位[139] - 公司于2017年6月在加拿大安大略省成立,并于2019年10月在美国特拉华州重新注册[141] - 公司符合《乔布斯法案》定义的"新兴成长公司"资格,可享受简化披露要求[142] - 作为新兴成长公司,若公司总年收入达到或超过12.3亿美元,将失去该资格[142] - 作为新兴成长公司,若公司非关联方持有的普通股市值超过7亿美元,可能被视为大型加速申报者[142] - 公司当前的研究与开发活动及运营始于2020年[141] - 公司主要执行办公室位于加利福尼亚州南旧金山[141]