Nature子刊:何川团队开发RNA修饰测序新方法——LIME-seq,可用于癌症早筛
生物世界·2025-07-09 12:02
循环游离RNA(cfRNA)研究突破 - 循环游离RNA(cfRNA)是一类存在于血液中的短片段RNA,源自细胞凋亡、组织更新或外泌体释放,但因其易降解、含量低、片段短,长期未被视为液体活检的理想材料 [1] LIME-seq技术开发 - 芝加哥大学何川教授团队与香港科技大学张理升教授团队合作开发了新型RNA修饰测序方法LIME-seq(Low-Input Multiple Methylation Sequencing),可分析cfRNA中的修饰模式,检测人类基因组和微生物组来源的tRNA及小非编码RNA [2][5] - LIME-seq技术通过低输入量多重甲基化测序,突破了传统cfRNA检测的局限性 [3][5] 癌症早筛应用 - 在结直肠癌患者血浆样本中,微生物来源的cfRNA甲基化水平显著高于非癌对照者,能精准区分癌症患者与非癌个体 [8] - 胰腺癌样本中同样观察到微生物来源cfRNA甲基化水平的差异,表明LIME-seq可扩展至肠道及非肠道癌症的早期检测 [8] - 研究首次在超百例临床样本中系统性验证cfRNA修饰图谱用于癌症早筛的可行性,其修饰水平变化与肿瘤状态高度相关,且比传统RNA表达量检测更稳定、信号更早 [8] 技术优势与意义 - LIME-seq通过捕捉癌症早期的微弱生物学变化,为结直肠癌及其他癌症早筛提供了新思路 [8] - 研究揭示了微生物来源cfRNA广泛存在于人类血浆中,并明确了其修饰水平与肿瘤的关联性 [8]