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师从施一公及David Baker,西湖大学卢培龙团队发表Cell论文,首次从头设计电压门控阴离子通道
生物世界·2025-10-17 08:01

研究突破核心 - 西湖大学卢培龙团队在国际上首次实现了电压门控阴离子通道(dVGAC)的精确从头设计,该成果发表于《细胞》期刊[3][4] - 该人工通道的离子选择机制与电压响应机制均不同于天然离子通道,并在小鼠模型中证实可有效抑制神经元电活动[4] - 此突破标志着AI驱动的生物分子设计向实际应用迈出了关键一步,证明了从头设计具有“动态开关”功能的跨膜蛋白的能力[4][23] 技术方法与设计验证 - 研究团队采用参数化方程与片段组装相结合的方法,从头设计了一个由15根α螺旋组成的五聚体跨膜蛋白骨架TMH3C5,形成两层同心环结构[6][7] - 利用ProteinMPNN设计氨基酸序列,并通过AlphaFold2预测三维结构,筛选出8个结构与预测模型高度一致的跨膜蛋白设计体[15] - 冷冻电镜解析结果显示,跨膜蛋白tmZC8-BTB的整体结构与设计模型高度吻合,跨膜区Cα原子的RMSD仅为1.33 Å,验证了设计的准确性[15] 通道功能特性 - 在设计的跨膜五聚体蛋白孔道内引入精氨酸作为门控残基,其中一个变体tmZC8-3R-BTB在膜电位超过40 mV时电流迅速上升,表现出显著的电压依赖性[18] - 该通道高度选择性地通透氯离子(Cl⁻),阴离子通透顺序为Cl⁻ > Br⁻ > F⁻ > NO₃⁻ > I⁻,单通道电导恒定但开放概率随电压升高而增加[18] - 解析的dVGAC冷冻电镜结构分辨率达2.9 Å,实际构象与设计模型高度一致,跨膜区Cα原子的RMSD仅为1.09 Å[19] 功能调控与应用潜力 - 通过改变孔道内的氨基酸残基,成功调控了dVGAC的离子选择性与电压敏感性,dVGAC1.0突变体在仅20 mV的膜电位下即可激活[21] - 在活体小鼠实验中,表达dVGAC1.0的神经元放电频率显著降低,证实了该人工通道在生理条件下具备调控神经元活动的能力[22] - 该技术实现了从设计“静态”膜蛋白结构到设计具有“动态”响应能力的跨膜蛋白的跨越,为构建响应特定信号的新型跨膜蛋白提供了可行路径[23] 团队研究历程 - 卢培龙研究员团队在跨膜蛋白设计领域持续取得突破,包括2020年在《自然》发表世界首次跨膜孔蛋白精确从头设计,2018年在《科学》发表世界首次多达8个跨膜区域的跨膜蛋白精确从头设计[35][36][39] - 团队近期研究成果还包括2025年2月在《自然》发表的跨膜荧光激活蛋白设计,以及2024年发表的广谱迷你中和蛋白设计和异手性蛋白复合物设计[25][27][29][32]