研究概述 - 中山大学研究团队在《Nature Cell Biology》发表论文，系统性解析了人类HeLa细胞中18种核内无膜凝聚体的蛋白网络，并构建了首个人类核内凝聚体全景地图——NOVA Map [3][4] 技术方法与核心发现 - 研究利用自主开发的PhastID邻近标记技术，鉴定了18种核内凝聚体的蛋白互作网络，共获得2390个显著富集蛋白及10126对邻近互作 [7] - 功能聚类显示，核内凝聚体可分为两类：一类富集DNA损伤修复、表观修饰等DNA相关复合体，另一类偏向RNA剪切、RNP组装等RNA相关过程，PML小体与卡哈尔小体是两类间的功能桥梁 [7] - 序列分析表明，核心蛋白含有高比例的固有无序区以推动相分离，且不同凝聚体的基序富集模式存在差异 [7] - 通过自主生物信息学算法，研究发现Gems小体与卡哈尔小体以“协作”模式调控端粒酶成熟，与组蛋白基因位点小体则以“协作+U7 snRNP组分传递”模式促进组蛋白mRNA前体加工 [8] - 基于相似度关联算法，研究鉴定并报道了一种新型核内凝聚体——BUD13凝聚体，该凝聚体对放线菌素D处理及紫外辐射高度敏感，推测其同时参与RNA加工与DNA损伤应答 [8] 研究成果与应用潜力 - 研究整合了311个已发表的邻近蛋白质组及54个PhastID测试数据集，构建了人类细胞核凝聚体全景地图NOVA Map [10] - 利用NOVA Map解析了胰腺神经内分泌瘤中DAXX蛋白高频突变的核内分布及互作特征，凸显了其在疾病研究中的临床应用潜力 [10] - 热休克实验表明，热休克因子-1在热刺激下迁移至PML小体附近及异染色质区域，参与热刺激应答；在15分钟热刺激下，多数凝聚体保持稳定，而卡哈尔小体与Gems小体的交流增强并促进了hTR前体加工，证实NOVA Map可作为应激研究的有效工具 [10] - 该研究为理解核内无膜凝聚体的整体构架、动态调控机制及其在疾病和应激反应中的作用提供了系统框架和关键资源 [12]