Cell:已灭绝猛犸象的古RNA表达谱
生物世界·2025-12-26 16:45
古RNA技术突破 - 研究团队在《细胞》期刊发表论文,报告了从10头晚更新世时期的猛犸象中获取转录组图谱,其中一份约39000年前的样本提供了迄今为止记录到的最古老的古RNA序列 [2] - 该研究成功从古代样本中恢复骨骼肌代谢所必需的组织特异性调控机制和生物功能,展示了研究古RNA分子的潜力,突破了先前设想的局限 [2] - 研究提出了一种用于分离和分析古RNA分子的方法框架,包括质量控制措施、测序深度考量和序列分析,以排除DNA污染并确定序列的内源性起源 [6] 古RNA研究的价值与挑战 - RNA分子在细胞代谢中发挥关键作用,包括携带编码信息、生成蛋白质、调控基因表达以及作为核酶催化反应,这些动态的转录变化信息无法仅从基因组DNA中直接获取 [4] - 古RNA研究面临特殊难题,因为RNA会被核糖核酸酶迅速降解,生物死后很难留存,尽管已有从福尔马林固定组织中对历史RNA病毒(如H1N1流感病毒)测序的成功案例,但该领域仍处于起步阶段 [5] - 从猛犸象样本中鉴定出几种肌肉特异性mRNA,并基于古RNA序列的基因表达证据,在猛犸象基因组中发现了可能的新型miRNA候选基因位点 [6] 研究成果与未来展望 - 研究亮点包括:证实晚更新世猛犸象组织中保存有古RNA分子;转录数据能够对新的非编码基因座进行注释;组织特异性基因表达模式在长时间内得以保持 [7] - 研究表明,有可能从大约4万年前的古代样本中提取、测序、分析和验证转录组图谱,这为从广泛的更新世遗骸(包括已灭绝和现存物种)中生成古RNA图谱打开了大门 [9] - 基于此项研究,预计未来将会出现将基因组学、蛋白质组学和转录组学相结合的综合古生物学研究 [10]