编辑丨王多鱼 排版丨水成文 细胞的功能不仅取决于其自身的基因表达，更取决于其在三维 （3D） 空间中的位置以及与周围微环境的 3D 互作，理解组织结构的 3D 复杂性是解析生物功能的关键。然而，当前主流的空间转录组学 （Spatial Transcriptomics，ST） 技术大多局限于二维 （2D） 平面，这种观测维度的局限导致我们难以还原器官 内部基因表达的连续梯度、细胞细胞微环境的立体分布以及精细的细胞互作网络。 尽管研究者们试图在Z轴上堆叠多张 2D 切片以近似三维结构，但受限于高昂的实验成本与有限的实验通 量，不得不对 Z 轴方向的采样密度做出妥协。这种折衷方案导致切片之间往往存在不可忽视的物理间距 （例如100微米 ，相当于缺失了约 5-10 层细胞的信息 ） ，使得最终获取的数据在Z轴上呈现为高度稀疏 的采样状态。这种采样方式将原本连续的生物组织割裂为离散的稀疏的断层面，使得现有的三维图谱往往 缺乏连续性与完整性。 2025 年 12 月 31 日，复旦大学 冯建峰 / 原致远 团队联合中国科学院计算技术研究所 赵屹 团队，在 Nature Methods 期刊发表了题为： Bridging ...