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创新计算框架揭示癌症“进化策略”
科技日报· 2025-05-16 09:22
研究背景与意义 - 西班牙巴塞罗那生物医学研究所团队开发出DiffInvex计算框架,可追踪健康细胞转变为肿瘤及肿瘤在化疗中的基因进化压力 [1] - 该研究分析了超过11000个样本,涵盖约30种不同组织类型的人类癌症和健康组织基因组数据 [1] - 研究成功识别出导致肿瘤对治疗产生耐药性的路径,并指出可能引发耐药性的基因 [1] 技术方法与发现 - DiffInvex通过分析编码基因区域与非编码区域的突变情况,确定"中性"突变率基线,消除评估不确定性 [2] - 鉴定出11个在特定类型化疗后突变频率显著增加的基因,包括IK3CA、SMAD4和STK11等关键驱动基因 [2] - 对比1722个健康组织和肿瘤基因组,发现部分癌症驱动因子可能是进化产物而非疾病启动直接原因 [2] 应用价值与前景 - 为合理设计药物组合提供可能性,如将标准化疗与针对PIK3CA或STK11信号通路的抑制剂结合使用 [2] - 有助于改进早期检测方法,减少患者不必要焦虑 [2] - 首次系统揭示化疗过程中肿瘤进化机制,是肿瘤认识的突破性理解和癌症基因组学与计算生物学融合的里程碑 [3] 行业影响 - 研究结果发表于《自然·通讯》杂志,显示癌症基础研究正从静态基因分析迈向动态演化追踪 [1][3] - 解决了化疗引起新DNA损伤和多种药物联合治疗下难以确定癌细胞存活原因的挑战 [1] - 为破解肿瘤细胞对化疗产生耐药性导致复发的难题提供了全新视角 [3]