iPEX
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西湖大学最新Nature论文:开发微米级分辨率的深度空间蛋白质组学技术——iPEX
生物世界· 2025-11-13 08:15
技术突破 - 开发了名为iPEX的新型空间蛋白质组学技术,该技术融合了基于水凝胶的蛋白质锚定、组织膨胀与基质辅助激光解吸/电离质谱成像(MALDI-MSI)[3] - iPEX技术突破了传统空间蛋白质组学在分辨率和检测灵敏度上的瓶颈,将蛋白质鉴定的灵敏度大幅提高10-100倍[4][6] - 该技术实现了在多种组织中以1-5微米有效像素尺寸、无偏、高通量地检测数百至逾千种蛋白质[4][8] 技术性能与应用 - 以视网膜为模型,iPEX实现了高精度的空间蛋白质组图谱构建,单细胞层和细胞外结构的可视化以及共定位蛋白质的识别[8] - 该技术能够轻松应用于大脑、肠道、肝脏和类器官在内的多种组织,在1-5微米的有效像素尺寸下检测到600-1500种蛋白质[8] - 应用iPEX技术描绘5xFAD阿尔茨海默病小鼠大脑的空间蛋白质组图谱,揭示了疾病早期发生的线粒体异常[8] 疾病机制发现 - 在阿尔茨海默病小鼠模型研究中,发现疾病早期发生过氧化物酶体乙酰辅酶A酰基转移酶ACAA1的表达水平下降,其N392S突变体是阿尔茨海默病的单基因风险因素[8] - ACAA1基因缺失阻断了长链多不饱和脂肪酸(包括二十二碳六烯酸)的生物合成,这些脂质组的改变在神经退行性病变的早期阶段发挥作用[8]