研究项目 - 构建全球首个10万规模鸡参考面板项目100K GCRP 第一阶段成果基于11951个鸡基因组 建立全球首个鸡类参考基因组资源库 [1] - 第一阶段采用低深度测序获得10104份商品鸡样本 结合1847个高深度测序样本 构建两个高质量子面板CBP与CMP [3] - 项目由中国农业大学团队牵头 联合国内外多个单位合作完成 旨在为鸡种遗传变异图谱构建和精准育种提供基础支撑 [1] 技术应用 - 华大智造DNBSEQ-T7基因测序平台及MGISP-960 MGISTP-7000系统提供从样本处理到基因测序的全流程支持 [2] - 低深度测序技术实现年处理100万样本规模 成本与效率双突破 数据重复序列率低于进口平台 [3] - 自动化设备配套形成从提取建库到测序的全产业链闭环生态系统 技术将推广至猪鸡等经济动物育种企业 [3] 行业背景 - 鸡驯化历史约8000年 原鸡为首个完成全基因组测序的鸟类 公共变异数据库已收录约2343万个SNP和240万个InDel [2] - 低深度测序技术弥补传统SNP芯片覆盖不足 为基因组选择与变异定位提供新可能 [2] - 畜禽全基因组选择面临样本量大、成本要求苛刻问题 一站式解决平台业务模式有效应对产业需求 [2]