研究概述 - 复旦大学、芝加哥大学和北京航空航天大学的研究团队在《Cell》期刊发表了一项研究，成功绘制了实验小鼠的全身分子和细胞图谱 [2] - 该研究为在实验小鼠中开展全身空间分子研究提供了一个统一的框架 [9] 研究方法与数据 - 研究团队生成了全小鼠切片的时空转录组学图谱，能够准确捕捉组织学区域 [4] - 研究构建了一个包含5900万个单细胞的参考数据集 [4] - 结合可扩展的细胞类型分配计算方法，在全小鼠切片图谱中对379种细胞类型进行了空间定位 [4] 技术成果与算法 - 研究团队利用全小鼠图谱创建了一个名为“LABEL”的机器学习方法 [4] - LABEL算法能够对来自H&E染色切片的组织学图像进行全身组织和细胞类型的注释 [4][6] 研究应用与发现 - 研究团队将全小鼠空间分析应用于内毒素血症，描绘了全身性炎症在组织和细胞类型中基因表达程序的全组织变化 [4] - 全身图谱揭示了小鼠内毒素血症的全身性炎症特性 [9] 研究意义与前景 - 这项工作为研究实验小鼠在空间、时间和条件下的分子和细胞过程的全身性研究铺平了道路 [7] - 研究提供了6周龄小鼠全身切片的全转录组谱 [6]