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Cell:中科院深圳先进院甘海云团队揭示ecDNA维持的关键机制
生物世界· 2025-04-28 16:44
染色体外DNA (ecDNA) 的生物学特性与肿瘤关联 - ecDNA是一种独立于染色体存在的环状DNA分子,在30%-50%的恶性肿瘤患者中被检测到 [2] - ecDNA可携带完整的致癌基因(如MYC、EGFR)及其增强子序列,当这些基因从染色体脱落并环化形成ecDNA后,表观遗传修饰记忆丢失,导致癌基因异常激活 [2] - 携带ecDNA的肿瘤患者往往表现出更高恶性程度、更强治疗抵抗和更差临床预后 [2] ecDNA复制与维持机制研究突破 - 研究团队采用CRISPR-Cas9基因编辑技术构建了稳定携带EGFR基因完整拷贝的ecDNA细胞系 [4] - 创新性结合体外人工染色体组装技术,构建了模拟临床患者来源的人工ecDNA分子,解决了缺乏严格匹配的ecDNA阳性/阴性对照的难题 [4] - 通过EdU处理基因工程细胞系,获得了ecDNA在活细胞内进行自主复制的直接证据 [6] ecDNA与DNA损伤应答的双向调控关系 - 携带ecDNA的细胞表现出更严重的基因组不稳定特征,DNA双链断裂(DSB)水平显著升高 [7] - ATM激酶介导的DNA损伤应答通路在ecDNA阳性细胞中被特异性激活 [7] - ecDNA的稳定维持高度依赖特定的DNA损伤修复途径,特别是替代性非同源末端连接(alt-NHEJ)通路 [11] - 特异性抑制alt-NHEJ能显著降低细胞内ecDNA的丰度,可能成为选择性清除肿瘤细胞中ecDNA的有效手段 [11] 潜在治疗策略探索 - 使用携带ecDNA的细胞对DDR关键因子如ATM、CHK、TOP1等抑制剂更加敏感,这些抑制剂能够显著降低细胞内ecDNA含量 [14] - 靶向ecDNA维持过程很有可能成为携带ecDNA肿瘤的通用治疗手段 [14] - 基于ecDNA分子特征开发的靶向药物或将成为30%-50% ecDNA阳性肿瘤患者的精准治疗选择 [15] 研究意义与拓展应用 - 揭示了ecDNA通过平衡态调控参与肿瘤发生发展的分子机制,为临床转化提供了新靶点 [15] - 环状DNA复制维持机制可能拓展肿瘤生物学的认知边界,提示HPV等DNA病毒的复制可能同样依赖类似DDR通路调控模式 [15] - 为病原体环状DNA复制机制研究开辟新方向,为抗病毒治疗策略研发提供重要理论依据 [15]
全球首个高精度完整肝脏三维病理图谱发布,研究团队来自上海
澎湃新闻· 2025-03-25 19:32
研究突破 - 全球首个高精度完整肝脏三维病理图谱发布 实现0.35×0.35×2微米超高分辨率三维成像 在细胞尺度构建肝脏数字孪生体[1][3][4] - 采用显微光学切片断层成像技术 完整呈现肝脏各叶 胆囊及中央静脉 门静脉 动脉 胆管 肝血窦和肝细胞的关键结构空间关系[4] - 首次捕获传统手段无法观测的胆管周围微血管丛等精细结构 为跨尺度精确表征肝脏解剖结构和疾病病理变化奠定基础[4] 技术应用 - 构建肝纤维化模型小鼠肝脏病理图谱 发现肝细胞脂肪变性严重程度与距离中央静脉的距离密切相关 距离越近脂肪变性越严重[6] - 采用深度学习技术自动分割分析三维病理图谱大数据 自动识别分割脂肪变性肝细胞并精确计算体积比例[6] - 肝纤维化小鼠肝脏中脂肪变性肝细胞体积比例高达30.76% 不同肝脏叶间脂肪变性程度相对一致[6] 临床价值 - 技术体系适用于基础研究和临床诊断治疗 使肝脏疾病诊断能更直观全面反映三维结构和病理变化[7] - 为破解肝纤维化等慢性肝病难题提供革命性研究工具 中国脂肪肝患者已超过2亿 全球每年因肝硬化死亡人数超过百万[3][7] - 未来有望推广至其他肝脏疾病研究和临床病理研究 为开发更有效治疗策略提供支持[7]