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基因表达噪声图谱
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Cell Reports:龙尔平/张同武等构建基因表达噪声图谱,解析基因表达噪声的遗传密码和疾病易感新机制
生物世界· 2025-11-24 08:08
研究核心观点 - 研究团队构建了首个基于百万级单细胞数据的基因表达噪声图谱,并系统鉴定了控制基因表达噪声的遗传位点(enQTL)[2][3] - 研究发现控制基因表达噪声的遗传位点(enQTL)在很大程度上(89.1%)独立于传统控制表达水平的遗传位点(eQTL),揭示了一套全新的遗传调控机制[3][9] - 基因表达噪声是可遗传的分子性状,其调控异常与自身免疫病等复杂疾病相关,为理解疾病遗传基础提供了全新视角[3][14][17] 基因表达噪声图谱构建 - 研究利用981名健康个体的123万个外周血单细胞转录组数据,建立了标准化的噪声分析流程[7] - 通过引入Gamma分布模型和残差校正算法,成功分离出生物学噪音,构建了包含8种免疫细胞类型的基因表达噪声图谱[7] - 图谱揭示表达噪声随年龄增长而升高,且男性表达噪声显著高于女性[7] - 鉴定出437个高变异基因(HVG),这些基因显著富集在免疫应答和细胞周期相关通路中[7] enQTL鉴定与特征 - 在全基因组范围内鉴定出10770个独立的enQTL,这些enQTL调控6743个相关基因(enGene)[9] - 89.1%的enQTL与传统的eQTL在遗传上互不连锁,且enQTL倾向位于基因组的抑制性染色质区域[9] - 仅3.5%的enQTL是细胞间共有的,绝大多数enQTL呈现细胞特异性,表明噪声调控的复杂性[9] 疾病关联与生物学意义 - 通过共定位分析鉴定出625个与人类疾病和复杂性状相关的enQTL共定位事件[14] - 研究发现MTHFR基因的致病性错义突变rs1801133可能通过染色质交互作用调控CD8细胞中KIAA2013基因的表达噪声[14] - 在系统性红斑狼疮等自身免疫病中,致病风险变异往往导致关键免疫基因的表达噪声降低(即表达过于稳定),提示适度的表达波动对免疫系统保持弹性可能至关重要[17]