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Cell子刊:同济大学张勇团队开发表征染色质转录调控网络的AI基础模型——ChromBERT
生物世界· 2026-02-02 12:06
编辑丨王多鱼 排版丨水成文 基因表达 由 转录调控因子、顺式调控元件与靶基因之间的相互作用共同构成的 转录调控网络 ( Transcriptional Regulatory Network, TRN ) 塑造。长期以 来,破译特定情境的 转录调控网络 ( TRN ) 一直受到细胞类型特异性染色质免疫沉淀测序 (ChIP-seq) 数据严重稀缺的限制。 2026 年 1 月 26 日,同济大学 张勇 教授团队 ( 余招伟 、 杨东旭 、 陈倩倩 、 张雨轩 为论文共同第一作者 ) 在 Cell Genomics 期刊 发表了题为: ChromBERT: A foundation model for learning interpretable representations for context-specific transcriptional regulatory networks 的研究论文。 该研究构建 并发布了 首个解码和可解释性地表征染色质上转录调控网络的基础模型—— ChromBERT 。 ChromBERT 通过在 大量 人类 ChIP-seq 数据上进行 预训练, 学习到了 全基因组 位点特异 ...