泛癌图谱

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同济大学发表最新Nature Cancer论文
生物世界· 2025-08-26 16:15
研究背景与意义 - 癌症发展是多步骤过程,涉及癌细胞克服复制限制和逃避免疫系统破坏,同时非癌细胞被重编程以支持肿瘤生长[3] - 肿瘤发生器官的独特驻留细胞类型导致肿瘤微环境(TME)显著差异,影响分子亚型、侵袭能力和治疗反应[3] - 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和空间转录组学(ST)是探索肿瘤微环境多样性的强大工具[3] - 从泛癌角度探究TME成分动态变化和细胞间相互作用对阐明癌症发病机制至关重要[3] 研究数据与方法 - 研究集成公共数据集中36种癌症类型、746个样本的超过400万个单细胞数据,以及6种癌症类型62个样本的空间转录组学数据[4] - 数据涵盖癌旁正常组织、癌前病变组织、肿瘤组织和转移性肿瘤样本[5] - 建立系统描绘肿瘤微环境异质性的泛癌图谱TabulaTIME(http://wanglab-compbio.cn/TabulaTIME/)[5] - 对泛癌尺度TME内多个细胞谱系进行详细注释,分为杀伤型淋巴细胞、调控型淋巴细胞、B淋巴细胞、髓系细胞、成纤维细胞及内皮细胞六大主要谱系[5] 研究发现与成果 - 构建涵盖36种不同癌症类型的TME细胞综合图谱,定义六大主要细胞谱系和56种细胞亚型[7] - CTHRC1是细胞外基质相关癌症相关成纤维细胞(CAF)的标志物,在不同癌症类型中富集[9] - CTHRC1+ CAF位于恶性区域和正常区域之间的前沿,可能阻止免疫细胞浸润[9] - SLPI+ 巨噬细胞表现出促纤维化相关表型,并与CTHRC1+ CAF共定位形成独特空间生态型[9] - TabulaTIME可用于分析肿瘤生态型组成,并作为细胞类型注释的参考[9] 研究应用与价值 - 全面TME蓝图为理解肿瘤微环境复杂性、识别表型相关细胞类型提供宝贵路线图[7] - 研究为癌症治疗中靶向促纤维化生态型提供潜在治疗策略[9] - 识别在肿瘤发生和进展过程中起重要作用的细胞亚型,探讨其与预后的关系[5] - 对肿瘤特异细胞类型和多细胞互作进行深度分析[5]