家犬古基因组研究 - 研究团队完成了17个古代家犬的基因组测序 这是首次获得中国古代家犬基因组[1] - 基于73个古代狗基因组构建了从东亚到西欧亚草原的家犬血统演变图谱[1] - 发现中国5000年前存在独特的家犬古老血统 随后数千年出现来自西伯利亚和西方血统的渗入 同时中国的古老东亚祖份也广泛扩散到欧亚草原[1] - 家犬的血统渗入事件与人类的多次迁徙高度重合 近1万年来家犬与人类曾密切共迁徙[1][2] - 万年来从欧亚草原到河西走廊的家犬血统流动映射着古代文明的互联互通[2] - 基于古基因组分析的方法将扩展到其他家养动物 以发掘国内家养动物丰富的遗传资源潜力[2] 猕猴生物资源研究 - 研究团队收集了919只中国猕猴的基因组数据以及52种表型数据[3] - 首次揭示中国猕猴群体具有独特的遗传优势 包括更高的遗传多样性和更低的遗传负荷[3] - 发现DISC1基因的有害突变会导致猕猴出现与人类精神疾病相似的表型 为精神疾病研究提供了理想动物模型[3] - 发现不同猕猴个体在药物靶基因功能上存在显著差异 提示在药效学评价前应对相关药物靶基因进行基因分型或测序[3] 长臂猿基因组研究 - 研究构建了全球范围内迄今最全面的长臂猿基因组数据集 覆盖了18个现存长臂猿物种[4] - 以确凿的基因组证据揭示了长臂猿属、冠长臂猿属、合趾猿属和白眉长臂猿属的演化关系[4] - 在长臂猿体内调控脊椎动物肢体发育的核心基因关键调控区内 识别出一个特异性缺失片段[4] - 携带此结构变异的转基因小鼠模型实验显示 小鼠四肢骨骼表现出显著的相对增长 表明该变异可能在长臂猿四肢伸长演化中发挥关键作用[4]

家犬古基因组研究 - 中国科学院昆明动物研究所主导的国际团队完成了17个中国古代家犬的基因组测序 这是首次获得中国古代家犬基因组[2] - 研究基于73个古代狗基因组构建了从东亚到西欧亚草原的家犬血统演变图谱 发现中国5000年前存在独特的家犬古老血统[2] - 此后数千年 中国古代家犬逐渐出现来自西伯利亚和西方的古代家犬血统渗入 同时来自中国的古老东亚祖份也广泛扩散到欧亚草原多处[2] - 研究发现家犬数次血统渗入事件与人类的多次迁徙高度重合 近1万年来家犬与人类曾密切共迁徙[3] - 不同时期、不同人群携带各自的犬通过欧亚草原和古丝绸之路等进行跨洲大迁徙 映射古代文明的互联互通[3] - 基于古基因组分析的方法将扩展到其他家养动物 以发掘国内家养动物丰富的遗传资源潜力[3] 猕猴生物资源库计划 - 中国科学院昆明动物研究所于2023年依托国家非人灵长类重大科技基础设施启动了“猕猴生物资源库”计划[4] - 研究人员收集到919只中国猕猴的基因组数据以及52种表型数据 取得阶段性进展[4] - 首次揭示中国猕猴群体具有独特的遗传优势 包括更高的遗传多样性和更低的遗传负荷[4] - 猕猴突变特征的景观图谱与现有的人群队列存在诸多相似之处[4] - 研究发现DISC1基因的有害突变会导致猕猴出现与人类精神疾病相似的表型 为精神疾病研究提供了理想动物模型[4] - 研究发现不同猕猴个体在药物靶基因功能上存在显著差异 提示在开展药效学评价前应对相关药物靶基因进行基因分型或测序[4] 长臂猿基因组计划 - 中国科学院昆明动物研究所联合国内外多家科研机构发起的国际“灵长类基因组计划”系统阐明了长臂猿科的演化历程及其标志性长臂表型的遗传基础[5] - 研究团队构建了全球范围内迄今最全面的长臂猿基因组数据集 覆盖了18个现存长臂猿物种[5] - 研究以确凿的基因组证据揭示了长臂猿属、冠长臂猿属、合趾猿属和白眉长臂猿属的演化关系[5] - 通过多物种比较基因组学分析 在长臂猿体内调控脊椎动物肢体发育核心基因的关键调控区内识别出一个特异性缺失片段[5] - 构建的携带此结构变异的转基因小鼠模型实验显示 与野生型小鼠相比 转基因小鼠四肢骨骼表现出显著的相对增长[5] - 这表明该结构变异可能在长臂猿四肢伸长演化过程中发挥了关键作用[5]

研究核心成果 - 成功解析长臂猿系统演化关系、濒危历史及长臂表型遗传基础等关键科学问题 [2] - 相关成果于《细胞》期刊发表 [2] 研究方法与数据 - 研究依托模式动物表型与遗传研究国家重大科技基础设施（灵长类设施）进行 [2] - 构建迄今最全面的长臂猿基因组数据集，覆盖18个现存长臂猿物种 [2] - 成功获取包括已灭绝的君子长臂猿在内的3个古代样本的线粒体基因组 [2] 具体科学发现 - 首次明确长臂猿四大属的演化顺序，重绘长臂猿演化树，解决百年分类争议 [3] - 证实秦始皇祖母墓中发现的君子长臂猿归属于冠长臂猿属 [3] - 基因组分析显示多数长臂猿在10万至20万年前的晚更新世经历种群瓶颈期，约7万年前同步恢复，与全球气候变化相关 [3] - 发现现存白眉长臂猿属遗传多样性极低、近交水平高 [3] - 揭示长臂猿SHH基因关键调控区存在特异性缺失，并通过转基因小鼠实验验证该缺失可导致四肢骨骼相对增长 [3] 项目背景与设施意义 - 该研究是昆明动物研究所牵头发起的国际灵长类基因组计划的重要成果 [4] - 研究所管理运维的灵长类设施将持续为全球生命科学研究提供高通量、精准化研究平台 [4]