文章核心观点 - PacBio公司宣布其HiFi长读长全基因组测序技术将被华盛顿大学医学院和西雅图儿童医院的研究团队用作一线方法，用于研究儿童不明原因猝死综合征，该项目旨在通过分析200个受影响家庭的三重样本，提高诊断率并简化工作流程 [1] 技术应用与项目细节 - 研究项目将使用PacBio的Revio测序系统和SPRQ-Nx化学试剂，对200个因SUDC失去孩子的家庭进行三重样本测序 [1] - 该项目由SUDC基金会资助，并得到PacBio的实物支持，将优先使用HiFi长读长数据进行全面的变异检测 [1] - 采用HiFi测序作为一线检测方法，旨在整合并简化实验室工作流程，特别是在处理尸检组织和新生儿干血斑等具有挑战性的样本时 [2] - 研究人员希望通过解析结构变异和串联重复等复杂变异，并结合父母样本数据来阐明新生突变和遗传风险因素，从而提高诊断率 [2] 合作与行业影响 - 华盛顿大学团队将加入HiFi Solves全球联盟，该联盟汇集了全球机构，旨在研究基于HiFi的人类基因组测序在临床研究应用中的价值，并加深对遗传疾病的理解 [1] - 研究人员表示，将HiFi测序作为一线全基因组检测方法，能够以这些家庭应得的准确性和广度来寻找答案，通过长读长数据和父母样本，可以更好地解析困难变异、准确进行单倍型定相，并提供与SUDC相关的适当建议 [3] - PacBio全球营销副总裁表示，将高精度长读长全基因组测序作为起点可以加速发现，并最终为家庭找到更好的答案 [3] - SUDC基金会CEO表示，采用HiFi测序作为一线工具体现了对科学严谨性和同情心的承诺，这两项价值观指导着其理解、预测并最终预防SUDC的使命 [3] 公司技术与业务 - PacBio是一家领先的生命科学技术公司，设计、开发和制造先进的测序解决方案，以帮助科学家和临床研究人员解决遗传学复杂问题 [4] - 公司的产品和技术，包括HiFi长读长测序，为广泛的研究应用提供解决方案，包括人类种系测序、动植物科学、传染病与微生物学、肿瘤学和其他新兴应用 [4]

文章核心观点 PacBio公司宣布推出一种名为CiFi的新型社区开发方法 该方法通过将染色质构象捕获技术与HiFi长读长测序相结合 能够在单次测序运行中 即使样本材料有限 也能实现染色体级别、单倍型解析的基因组组装 该方法解决了传统短读长Hi-C技术的长期局限 为基因组生物学、生物多样性研究和功能基因组学提供了更高效、更准确的解决方案 [1][2][4] 技术方法与优势 - CiFi方法整合了染色质构象捕获与PacBio HiFi长读长测序 可产生包含多个染色质相互作用片段的长读长序列 显著增加了邻近连接实验的信息含量 [1][5] - 与传统Hi-C方法通常每个读长对仅捕获两个相互作用的基因组片段相比 CiFi能产生包含许多相互作用染色质片段的串联体HiFi读长 大幅提高了接触密度 同时保持了HiFi测序的准确性 [5] - 该方法在重复区域或结构复杂区域具有改进的定位能力 克服了低输入样本的性能障碍 实现了多接触分辨率 并通过单一平台的简易性节省了项目时间和复杂性 [2][3] - 当与Revio SPRQ化学试剂配对使用时 CiFi使得使用更少的细胞、更少的文库和更少的测序运行次数来生成参考质量级的组装成为可能 降低了因成本、复杂性或样本可用性而受限的基因组项目的门槛 [4] 应用成果与性能 - 在加州大学戴维斯分校Megan Dennis实验室发表于《自然通讯》的研究中展示了CiFi的能力 该方法生成了长且高度准确的读长 可在单个分子内捕获多个染色质相互作用 [2] - 作为方法能力演示 研究团队将CiFi工作流程应用于草原田鼠和草甸田鼠 生成的未经过人工整理的组装体 其支架N50值超过一亿碱基对 并且在许多支架的两端都检测到了端粒序列 [6] - 结果表明 结合HiFi测序的CiFi方法 仅通过一次测序运行 就能常规性地提供染色体级别、参考质量级的组装 [6] 战略意义与市场定位 - CiFi扩展了公司的多组学能力 增加了在现有HiFi测序系统上无需新硬件即可实现的功能 并解锁了新的客户应用场景 [4] - PacBio是一家领先的生命科学技术公司 致力于设计、开发和制造先进的测序解决方案 以帮助科学家和临床研究人员解决基因复杂性问题 其HiFi长读长测序等技术服务于人类种系测序、动植物科学、传染病与微生物学、肿瘤学等广泛的研究应用 [8]

研究核心发现 - PacBio HiFi测序技术结合Paraphase变异识别工具在研究中检测出所有125个已知致病性变异，检出率达到100% [1][2] - 该技术能够覆盖基因组中最难测序的区域，包括那些短读长测序技术无法检测的变异 [1][4] - 研究证明单次HiFi基因组测序可替代多种独立检测，有助于提高研究效率并节省时间和显著成本 [3] 技术性能指标 - 研究中每个样本均在单个SMRT Cell上测序，中位读长达到15.5 kb，平均单碱基准确率超过99.9% [3] - HiFi测序技术能够准确进行单倍型定相、解析基因与假基因之间的拷贝数变化，并检测基因转换等复杂事件 [3] - 该技术提供了超越传统短读长和靶向方法的全新水平的全单倍型分辨率和拷贝数精确度 [3] 临床验证与行业意义 - 这项多中心研究是HiFi Solves EMEA联盟的首个临床实用性研究，涉及欧洲5个机构的86名个体 [2][4] - 技术在多个诊断实验室和变异类型中表现出一致且准确的性能，证明了其稳健性和可重复性 [4][6] - 研究结果标志着长读长基因组测序向常规临床检测和罕见病诊断的广泛采纳迈出了关键一步 [4] 联盟背景与发展 - HiFi Solves联盟成立于2023年，旨在评估PacBio HiFi测序在人类健康应用中的实际效用 [5] - 该联盟目前包括来自16个国家的23个机构，覆盖欧洲、亚太和北美地区 [5] - 联盟联合了全球领先的研究中心和临床医生，致力于将数据转化为更深层次的理解，改变罕见病研究的可能性 [6]

公司财务信息 - 公司将于2025年11月5日美国东部时间下午4:30举行2025年第三季度财报电话会议 [1] - 电话会议可通过公司官网进行网络直播或收听回放 [1][2] 公司业务概览 - 公司是一家领先的生命科学技术公司，专注于设计、开发和制造先进的测序解决方案 [2] - 公司产品和技术包括HiFi长读长测序，应用于人类种系测序、动植物科学、传染病与微生物学、肿瘤学等多个研究领域 [2]

项目背景与意义 - PacBio的HiFi测序技术被选为韩国泛基因组参考计划的主要平台，该计划由韩国疾病管理厅和国立保健院主导[1] - 项目将生成首个大规模、端粒到端粒质量的韩国人群参考基因组，并将数据整合到全球人类泛基因组参考联盟中[2] - 项目旨在建立一个更具包容性和全面性的参考，以加速发现人群特异性变异，改善对不明原因疾病的见解，并支持精准诊断和疗法的开发[2] - 该项目标志着在捕捉韩国人群独特遗传多样性和将韩国数据纳入国际参考标准方面的新篇章[3] 项目具体规划与目标 - 韩国泛基因组项目于2024年9月5日由韩国国立保健院宣布，作为捕捉国家遗传多样性全国承诺的一部分[3] - 在2024年招募了200名研究人员和学术参与者进行试点后，项目现正扩展至公众成员，目标是对超过1000个全基因组进行测序[3] - 这是首个采用PacBio全套技术栈的国家级泛基因组计划，结合了DNA和RNA测序的准确性、完整性和分辨率[4] PacBio提供的技术解决方案 - PacBio将提供涵盖整个工作流程的集成测序解决方案，包括：HiFi全基因组测序为超过1000名预期参与者提供高精度长读长[8] - Kinnex全长RNA分析实现精确的转录组分析[8] - CiFi技术用于染色体规模分析，检测结构变异和复杂基因组特征[8] 公司业务概览 - PacBio是一家领先的生命科学技术公司，致力于设计、开发和制造先进的测序解决方案，以帮助科学家和临床研究人员解决复杂的遗传学问题[5] - 公司的产品和技术，包括HiFi长读长测序，针对广泛的研究应用提供解决方案，涵盖人类生殖系测序、动植物科学、传染病与微生物学、肿瘤学及其他新兴应用[5]

研究项目概述 - 美国国家老龄化研究所的长寿家庭研究选择PacBio的Revio系统，对多达7,800名参与者进行全面的基因组和表观基因组测序[1] - 该项目旨在揭示长寿在家族中遗传的原因以及驱动更健康老龄化的因素[1] - 这是迄今为止最大规模的健康老龄化研究之一[1] 技术优势与应用 - PacBio的HiFi长读长测序技术提供超过15kb的高精度读取，能够检测到短读长技术经常遗漏的结构变异、重复扩展、插入和分型单倍型[2] - 该技术的甲基化感知方案允许直接分析天然DNA中的5-甲基胞嘧啶特征[2] - 长读长HiFi测序的准确性和分辨率使研究人员能够看到其他技术遗漏的变异和甲基化模式[2] 研究规模与历史 - 长寿家庭研究是一项纵向多中心研究，迄今已在美国和丹麦招募了539个三代家系中的5,438名个体，并进行了近20年的三轮主要家庭表型访问[2] - 该项目最近获得美国国家老龄化研究所为期5年、总额8,000万美元的续期资助（2U19AG063893-06）[2] - 测序工作预计于2025年第四季度在华盛顿大学医学院麦克唐纳基因组研究所开始，首批约5,500个样本，全部约7,800个样本的计划跨度为五年[2] 项目目标与预期成果 - 通过从具有多个家族成员活到异常年龄的扩展家系中生成全面的基因组和表观基因组，旨在提高精确定位影响健康老龄化和异常长寿途径的能力[2] - 项目目标包括识别与长寿表型分离的罕见结构变异、将甲基化差异与基因调控、衰老轨迹或疾病抵抗力联系起来，以及整合表型和临床数据以产生健康老龄化的新假设[5] - 对异常长寿的遗传和表观遗传基础的进一步理解可能为精准老年科学、抗衰老疗法和新的恢复力生物标志物打开大门[2] 行业意义与公司角色 - 该研究被描述为有史以来最雄心勃勃的老龄化研究之一，也是首批大规模应用长读长和表观基因组测序的研究之一[2] - PacBio的Revio系统以其通量、成本效益和质量支持这项研究，使其能够产生稳健的基因组学见解[2] - PacBio是高质量、高精度长读长测序解决方案的领先提供商[1]

公司信息 - 公司为生命科学技术公司 设计开发和制造先进测序解决方案 助力解决基因复杂问题 [2] - 产品包括HiFi长读长测序 应用于人类生殖系测序、动植物科学等领域 [2] - 产品仅用于研究 不用于诊断程序 [3] 会议信息 - 公司将于2025年8月7日下午5点（东部时间）举行季度电话会议 讨论2025年第二季度财务结果 [1] - 会议将进行网络直播 可通过https://investor.pacificbiosciences.com/观看 [1][2] - 电话会议免费号码为1 - 888 - 349 - 0136 国际号码为1 - 412 - 317 - 0459 需提前10分钟拨入并表明参加“PacBio Q2 Earnings Call” [2] 联系方式 - 投资者联系Todd Friedman 邮箱ir@pacb.com [4] - 媒体联系邮箱pr@pacb.com [4]

项目概述 - Target ALS与PacBio合作启动全球最大规模的ALS全基因组测序计划，将对6000个ALS患者及健康对照样本进行HiFi长读长测序[1] - 该项目旨在检测结构变异、重复扩展等传统方法难以发现的遗传特征，数据将通过Target ALS Data Engine向全球科学家免费开放[1] - 90%的ALS患者病因不明，该项目通过社区样本采集和长读长测序技术结合探索新遗传病因[3] 技术优势 - PacBio HiFi测序可捕获1000-20000碱基对的DNA片段，远超短读长测序50-300碱基对的范围，能更准确解析基因组复杂区域[4] - 该技术可同步提供高质量转录亚型信息和甲基化图谱，揭示短读长测序无法发现的RNA表达及表观遗传变化[5] - 长读长测序特别适用于检测非编码区的调控元件异常，这些区域可能与运动神经元退化相关[2] 行业影响 - Target ALS Data Engine已建成ALS研究最全面的多组学数据库，此次新增的长读长数据将加速生物标志物和治疗靶点发现[7] - 项目通过社区临时诊所和全球自然病史研究扩大样本多样性，解决传统研究中样本获取受限的问题[7][8] - PacBio作为领先的长读长测序平台提供商，其HiFi技术可解析ALS复杂的遗传景观，推动神经退行性疾病研究[6][10] 组织背景 - Target ALS自2013年建立创新生态系统，通过开放工具、跨学科合作加速ALS药物研发[9] - PacBio专注于高精度测序技术开发，产品覆盖人类基因组、肿瘤学、传染病等多个研究领域[10]