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SIFI蛋白
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中国博后一作Nature论文:冷冻电镜+AlphaFold,揭开细胞压力警报系开关的精准调控机制
生物世界· 2025-05-11 17:00
应激反应与SIFI蛋白机制 - 慢性应激反应激活会损害细胞存活并导致退行性疾病,生物体通过E3泛素连接酶SIFI等沉默因子终止应激信号传导以维持细胞内稳态[2] - SIFI如何在细胞尺度上感知应激压力并及时使应激反应失活尚不清楚[3] - 加州大学伯克利分校团队解析了内源性SIFI的冷冻电镜结构,结合AlphaFold建模和生化分析,揭示了整合应激反应(ISR)沉默的结构和机制基础[4] 整合应激反应(ISR)的双重作用 - 细胞遭遇压力(如线粒体损伤)时会启动ISR,暂停非必需活动以集中资源修复损伤,但持续激活的ISR会导致神经退行性疾病[5] - 线粒体受损时,细胞通过激酶HRI激活ISR暂停蛋白质合成,若修复后警报未关闭,长期停工将导致细胞死亡并引发小脑共济失调、早发性痴呆等疾病[6] SIFI蛋白的结构与功能 - SIFI是E3泛素连接酶复合体,负责在压力解除后标记HRI和受损蛋白,引导其被蛋白酶体降解以重启细胞正常运作[7] - SIFI结构包含:1) 巨型脚手架结构(1.3MDa,由UBR4、KCMF1和钙调蛋白组成,形似双臂环抱的圆环);2) 中心传感器KCMF1的ZZ结构域识别特定降解信号蛋白;3) 外围催化臂UBR4与泛素结合酶UBE2A协同合成K48泛素链;4) 钙调蛋白铰链感知钙离子信号调控构象变化[9] SIFI的工作机制 - 广谱"质检":通过柔性结构域捕获多种应激相关蛋白(如未正确导入线粒体的前体蛋白)[12] - 启动"贴标":KCMF1给底物加首个泛素标签,若底物自带泛素(如HRI融合泛素)可跳过此步骤[13] - 精准"链式反应":UBRI4的UBL结构域将底物泛素传递给UBE2A,专一性连接K48位点形成降解信号链,破坏界面会导致应激信号失控[14] 医学应用前景 - 患者UBR4突变(如A2581T、R2584C)导致SIFI支架扭曲无法协调泛素传递,修复SIFI功能或抑制HRI可逆转病理表型[15] - SIFI的广谱底物结合能力为设计新型PROTAC分子提供模板,改造其ZZ或DOC2结构域可精准锁定癌细胞蛋白,突破"不可成药"蛋白靶向瓶颈[16]