SVAtlas
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山东大学侯庆振团队等发布首个单细胞外囊泡多组学数据库——SVAtlas
生物世界· 2025-11-24 18:08
细胞外囊泡(EV)行业技术背景 - 细胞外囊泡是携带蛋白质、核酸等重要生物分子的纳米级颗粒,广泛参与细胞间通讯及多种疾病的发生发展过程 [2] - EV存在于血液、尿液等易获取体液中,其稳定膜结构能保护内部分子,已成为癌症和神经退行性疾病等液体活检的理想研究对象 [2] - 但EV群体内部存在高度异质性,传统批量分析技术难以捕捉单个囊泡分子特征,导致关键疾病信号被掩盖,严重阻碍其临床应用进展 [2] 单EV分析技术平台SVAtlas的突破 - 山东大学研究团队构建了首个跨疾病、跨体液、跨物种的单个细胞外囊泡多组学图谱SVAtlas [3] - 该平台整合自主测序数据与全球276个科研项目成果,覆盖31种重大疾病、32种组织器官和10种生物体液的数据 [5] - 收录了来自超过1.37亿个单EV的8120个蛋白质条目和106个RNA条目,形成单EV研究的数据语言与参考标准 [5] SVAtlas平台功能特性 - 平台支持组织/器官异质性分析及疾病特异性亚群分析,通过全局聚类、高异质亚群选择及标志物组合差异热图展示单EV分布和特征 [7] - 提供内置计算生物学工具,支持数据浏览、预处理、聚类分析和交互式可视化,用户可上传自定义数据进行分组比较和差异标志物分析 [8] - 创新性集成基于大语言模型的AI问答工具,帮助用户高效驾驭复杂的单EV表征方法 [8] 行业应用前景与价值 - SVAtlas标志着单个EV研究进入标准化、多组学整合的新阶段,研究者可在统一平台探索EV异质性、发现潜在生物标志物 [10] - 平台提供自动化分析、可视化和AI问答系统,让单EV数据分析更高效直观 [10] - 随着更多数据和新型组学加入,SVAtlas有望成为液体活检、精准医学和疾病诊断的重要工具 [10]