基因表达

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Science:使用AI模型预测哪些启动子突变会改变基因表达
生物世界· 2025-08-11 12:02
撰文丨王聪 编辑丨王多鱼 排版丨水成文 在人类基因组中,基因的转录始于 启动子 (Promoter) ,这一核心序列元件整合来自基因组近端和远端 区域的信息,以精确调控基因表达。启动子中的破坏性突变会导致基因表达发生重大改变,但由于难以区 分有害突变和良性突变,其对人类健康和疾病的影响,我们目前仍知之甚少。 在大规模功能基因组学数据集上训练的 人工智能 (AI) 模型有可能学习转录和表观遗传程序背后的调 控"语法"。将遗传突变与功能后果相联系的适当训练数据集对于实现准确的突变效应预测至关重要。 实际上,目前仅有少数罕见遗传病患者通过外显子测序得到确诊,这表明其他未被识别的致病突变可能存 在于非编码序列 (包括启动子) 中。 PromoterAI 是一种通过评估启动子区域基因组序列来预测启动子突变对基因表达影响的深度神经网络。研 究团队首先以单核苷酸分辨率训练该模型,使其能够预测转录起始位点周围的组蛋白修饰、DNA 可及性、 转录因子结合和链特异性基因表达。随后,研究团队基于携带配对基因组与 RNA 测序数据的群体样本,构 建了包含数千个与跨组织异常基因表达相关的罕见启动子突变的训练数据集,同时控制了顺式 ( ...
可以改变你生活的 10 点领悟
36氪· 2025-05-02 08:06
神译局是36氪旗下编译团队,关注科技、商业、职场、生活等领域,重点介绍国外的新技术、新 观点、新风向。 编者按:一个人的思想和意识,有着改变身体和未来的"超能力"。改变能量,就能改变生活。本文来自编 译,希望对您有所启发。 2020 年初,我的人生跌入谷底,四年来我一直在进行疗愈和自我进化。在这段时间里,我了解、尝试和学习 了许多不同的治疗方法和模式,其中大多数都以某种方式为我的生活增添了价值,并加深了我对人类运作方 式的理解。更重要的是,这个旅程让我认识到,我们每个人都拥有与生俱来的力量,而这种力量大多尚未被 开发。最近,我在瑞士巴塞尔参加了乔·迪斯彭扎博士(Dr. Joe Dispenza)的渐进式疗养周活动,进一步丰富 了我的知识,也坚定了我帮助他人变得更健康、更快乐的决心。以下是10条来自疗养周的见解,或许能帮你 获得你想要的一切。 对于不熟悉乔·迪斯彭扎博士(Dr. Joe Dispenza)的人来说,我先介绍一下,他是一名脊椎按摩师、国际演讲 家、研究员、多部畅销书的作者和教育家,他热衷于从神经科学、表观遗传学和量子物理学领域的研究成果 中探索自发缓解背后的科学。他利用这些知识帮助人们治愈疾病、慢 ...