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Nature Methods:同济大学史偈君团队开发三代测序检测RNA修饰的算法基准平台,为多种修饰检测提供权威指南
生物世界· 2025-12-11 12:28
编辑丨王多鱼 排版丨水成文 RNA 修饰 是 " 表观转录组学 " 的核心研究对象,广泛参与 RNA 稳定性、剪接和翻译等生物学过程,精准调控 RNA 命运。牛津纳米孔技术 ( ONT) 推出了 直接 RNA 测序 ( DRS) 方案 , 无需扩增直接对 RNA 分子进行测序,通过捕捉其穿过纳米孔时产生的电信号差异,并借助计算建模区分不同修饰类型,从而 实现在单次实验中同时检测多种 RNA 修饰。随着该技术的应用,大量用于解析 DRS 数据中修饰信号的算法不断涌现。 然而,这些算法的性能究竟如何?能否准确区分不同的修饰类型?面对 DRS 技术的持续迭代,计算工具应如何适应?这些问题始终悬而未决。 2025 年 12 月 10 日,同济大学 史偈君 教授团队在 Nature Methods 期刊 发表了题为 : Systematic Evaluation of Computational Tools for Multitype RNA Modification Detection Using Nanopore Direct RNA Sequencing 的研究论文。 该研究构建了高质量、单碱基分辨率的基准数据集 ...