基因调控
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Cell:何川/魏江博全面总结RNA修饰在基因调控中的功能与通路
生物世界· 2026-03-23 16:48
文章核心观点 - 一篇发表于《细胞》期刊的综述文章系统总结了RNA修饰在基因调控中的功能与通路,标志着该领域已从早期发现m6A等修饰,发展到深入理解其在转录后调控、染色质状态调节及疾病治疗中的关键作用[3][4][18] RNA修饰领域的发展与现状 - 自2010年“RNA表观遗传学”概念提出及2011年FTO被鉴定为首个m6A去甲基化酶以来,该领域发展迅速,远超早期里程碑[3] - 目前已在细胞RNA中鉴定出超过170种修饰类型,m6A及其他修饰不仅调控转录后过程,还在转录水平上连接RNA代谢与染色质状态,从根本上改变了对基因表达调控的理解[3] - 对RNA修饰机制的深入理解正在催生新的疾病检测和治疗策略[3] 主要RNA修饰类型及其调控机制 - N6-甲基腺苷(m6A)是最普遍且研究最深入的内部RNA修饰[6] - 假尿嘧啶(Ψ)、2′-O-甲基化(Nm)、5-甲基胞嘧啶(m5C)、N7-甲基鸟苷(m7G)和N1-甲基腺苷(m1A)已成为多种RNA类别中的关键调控因子,在多种细胞过程中对基因表达产生广泛影响[6] - RNA修饰通过“写入器”、“擦除器”和“阅读器”这三类蛋白质效应因子发挥作用[6] - 在转录后,mRNA的修饰调控着整个RNA的生命周期,包括加工、剪接、核输出、稳定性、翻译和定位,这些机制对于在动态转变期间协调基因表达程序至关重要[12] 技术进展与研究方法 - 转录组范围内RNA修饰的高通量图谱绘制方法经历了一场革命,相关技术已从基于抗体的MeRIP-seq发展到单碱基分辨率图谱绘制、单细胞和长读长测序方法[8] - 这些技术进步使得对各种RNA修饰进行全面、特定背景的表征成为可能,极大地推动了对其调控作用和机制的研究[8] - 表1详细列举了m6A、Ψ、Nm、m5C、m7G、m1A这几种主要修饰的测序方法、效应蛋白及分子功能[10] RNA修饰在染色质与转录调控中的新兴作用 - 自2020年以来,该领域进入新前沿,开始探索染色质和转录调控中的RNA修饰[12] - 染色质相关调控RNA(carRNA),包括增强子RNA、启动子相关RNA以及从重复元件转录的RNA,都带有m6A、m5C等化学标记[12] - 这些carRNA修饰可被专门的阅读器识别,从而招募组蛋白修饰酶、染色质重塑因子等染色质因子,以调节局部染色质状态和转录[12] - 这种调控通常是顺式作用,carRNA上的修饰可以利用宿主RNA序列来实现调控特异性,可能通过整合多个转录因子网络,同时协调大量基因集的转录调控[13] 功能意义与未来方向 - mRNA m6A在肿瘤微环境中调控细胞自我更新与分化以及免疫反应[9] - RNA修饰在信号转导、应激适应、干细胞维持、早期发育、免疫和神经发生等各种情况下具有功能重要性[12] - 该综述强调了进一步研究以识别更多的carRNA修饰、阐明其机制以及明确其在发育和人类疾病中的作用的迫切需求[18] - 一些基础见解已开始为治疗开发提供信息,催化新型治疗策略的发展[4][18]
Sana Biotechnology (NasdaqGS:SANA) 2026 Conference Transcript
2026-03-12 02:42
公司概况 * 公司为Sana Biotechnology (NasdaqGS:SANA),是一家专注于细胞和基因疗法的生物技术公司,成立约7年[3] * 公司的核心愿景是调控基因并将细胞作为药物使用,以应对因细胞缺失或损伤导致的疾病[3] 核心技术与平台 * **低免疫(Hypoimmune)平台**:旨在解决异体细胞移植的免疫排斥问题[4] * 核心基因编辑策略:敲除MHC Class I和Class II基因(具体为β-2微球蛋白和CIITA基因),并过表达CD47,以“隐藏”细胞,使其不被免疫系统识别[16][17][32] * 该平台已通过体外实验、动物实验(小鼠、人源化小鼠、非人灵长类动物)以及人体实验验证[18] * 在人体中已应用于两种场景:异体CAR-T细胞和1型糖尿病治疗,均显示细胞可存活并发挥功能,且能克服异体排斥和自身免疫反应[19] * **体内递送(In Vivo Delivery)平台**:旨在实现细胞特异性、可重复且可扩展的体内基因治疗试剂递送[5] * 主要应用为制造体内CAR-T细胞,首个适应症为非霍奇金淋巴瘤[11] * 公司认为其平台在临床前(尤其是非人灵长类动物)数据中,在安全性、耐受性和疗效方面均属同类最佳[11] * 平台的两个关键设计理念:1) 细胞特异性递送对安全性、免疫原性和可制造性至关重要;2) 需要将信号整合到靶细胞DNA中,以实现CAR-T细胞的多对数级扩增,而基于mRNA的瞬时表达方法无法做到[67][68][69] 主要研发管线进展 1. 1型糖尿病(SC451项目) * **疾病背景与市场**:全球约1000万患者,美国约200万患者[7];现有胰岛素疗法下,患者平均寿命仍比未患病者短约10年[6] * **治疗原理**:移植经过低免疫基因编辑的胰岛细胞(产生胰岛素的β细胞及其支持结构)以替代缺失细胞[6][8] * **临床前/临床验证**: * 使用基因编辑的遗体来源胰岛细胞进行的概念验证性人体试验结果积极[9] * 患者自1987年确诊,移植前多年检测不到C肽(胰岛素分泌标志物)[33] * 移植后超过一年,患者持续产生C肽,并在进食后升高,表明细胞存活并功能正常[32][34] * PET-MRI成像显示移植到前臂的β细胞持续存在[34] * 免疫学检测未发现针对移植产品的免疫反应[34] * 安全性良好,未发现药物相关或潜在的副作用[34] * **下一步计划**: * 目标是开发基因修饰的干细胞来源胰岛细胞,以实现可扩展生产[9][32] * 已建立主细胞库(MCB),并解决了基因组稳定性、持久性和多能性维持等关键制造挑战[48] * 正在进行向GMP生产设施的工艺转移,并完成非临床测试(如GLP毒理学研究)[50] * 计划在今年提交研究性新药申请并启动一期研究[9][53] 2. 体内CAR-T细胞项目 * **首个适应症**:非霍奇金淋巴瘤[11] * **开发状态**:计划在今年启动人体研究并生成数据[11] * **未来扩展**:若在淋巴瘤中验证有效,将扩展至自身免疫性疾病、其他癌症(如多发性骨髓瘤)[12] * **竞争优势看法**:公司认为,相比基于mRNA/LNP的平台,其整合性方法可能带来显著更好的疗效和更深度的缓解;相比其他病毒样颗粒,可能具有更好的耐受性和安全性[70] 安全性与监管考量 * **对潜在风险的应对策略(针对低免疫平台细胞产品)**: 1. **降低风险**:确保基因组稳定性(避免致癌突变)和产品纯度[58] 2. **早期检测**:开发血液检测等方法以便早期发现问题[58] 3. **清除细胞**:三重保障:a) 将细胞植入肌肉,便于影像学观察、触诊和必要时手术切除[59];b) 在产品中嵌入“自杀开关”,可通过服用已获批的药物激活以杀死细胞[59];c) 使用抗CD47抗体,在临床前模型中已验证可杀死过表达CD47的细胞[61] * **患者随访**:预计将按FDA对细胞和基因疗法的要求,对患者进行至少15年的长期随访[64] 商业与合作前景 * **1型糖尿病项目**:被视为潜在的“功能性治愈”方法,公司表示除非特殊情况,否则很难考虑合作[71] * **体内CAR-T项目**:所处领域竞争激烈,拥有出色的开发计划并快速执行至关重要[71] * 公司对合作持开放态度,合适的合作伙伴可能有助于更快推进[72] * 人体数据对于验证平台价值和未来合作决策至关重要[72] 其他重要信息 * **遗体胰岛细胞试验的局限性**:虽然证明了生物学概念,但遗体来源不可扩展且具有变异性,且患者仍需终身免疫抑制[8] * **干细胞来源胰岛细胞的优势**:提供更可重复、更可扩展的细胞来源,但同样需解决免疫抑制问题[8] * **低免疫平台的普适性参考**:人体内唯一无需免疫抑制即可大规模频繁移植的细胞是红细胞,其特点正是不表达MHC Class I/II并显著过表达CD47[17] * **生产规模挑战**:治疗1型糖尿病需要巨大数量的细胞,例如治疗1000人约需1.5万亿细胞,凸显了可扩展制造和基因组稳定性的重要性[48]
内蒙古大学科研团队找到 紫花苜蓿抗旱增产“基因开关”
新浪财经· 2026-01-23 04:13
研究突破概述 - 内蒙古大学生命科学学院牛一丁教授团队在紫花苜蓿抗旱与生长调控机制研究方面取得重大突破[1] - 团队成功鉴定出一个名为ERF026的关键基因,该基因如同一把“分子开关”[1] - 该研究成果已发表于植物科学领域国际顶级期刊Plant Physiology[1] 研究背景与行业意义 - 紫花苜蓿被誉为“牧草之王”,是畜牧业的核心饲料作物,兼具极高经济与生态价值[1] - 紫花苜蓿对干旱胁迫极为敏感,严重制约了其在干旱、半干旱地区的产量与推广[1] - 作物育种中长期存在“生长—防御权衡”难题,即植物激活抗旱防御机制时往往以抑制生长、降低产量为代价[1] 核心科学发现 - 发现的ERF026基因属于AP2/ERF转录因子家族[1] - 研究首次揭示该基因是连接茉莉酸信号通路与植株生长发育的关键枢纽[1] - 该基因能够特异性识别基因上的一个全新DNA位点(STRE),并直接调控茉莉酸的生物合成[1] 基因功能与机制 - 抑制ERF026基因表达(令其“沉默”)能产生一箭双雕的奇效[2] - 在正常条件下,茉莉酸合成受抑,植株能将更多能量用于生长,生物量显著增加,同时叶片气孔密度降低,有效提高水分利用效率[2] - 当遭遇干旱时,植物防御机制被激活,切换到“防御模式”,植株在高效利用有限水分的同时,体内的抗氧化酶系统持续保持高效运行,提升了清除有害自由基、抵御干旱损伤的能力[2] - 通过调控这一个基因,即可同步实现“促生长”与“强抗旱”的双重目标,打破了传统认知中二者难以兼得的壁垒[2] 应用前景与行业影响 - 研究成果具有重要的应用前景,未来可通过基因编辑技术对其进行精准调控,定向培育出适应干旱地区种植、高产稳产的紫花苜蓿新种质[2] - 这不仅有助于保障我国畜牧业饲料安全,对干旱地区生态恢复与水土保持也将起到积极作用[2] 研究支持 - 该研究得到国家科技创新2030重大项目、国家自然科学基金和内蒙古自治区自然科学基金等项目支持[3]
解码小蚂蚁的“大智慧”
环球网资讯· 2025-06-18 11:08
蚂蚁演化历史与成功因素 - 全球蚂蚁现生物种超过1.5万个,总重量超过所有野生鸟类和哺乳动物总和 [1] - 蚂蚁至少在1亿年前的白垩纪时期已形成复杂社会组织,成为"生存大师" [1] - 中国科学家团队在《细胞》发表论文揭示蚂蚁社会系统演化机制及关键基因 [1] 蚂蚁社会组织的演化路径 - 原始蚂蚁社会遵循"单配制"繁殖模式,亲缘选择理论促成稳定生殖分工 [2] - 基础社会架构包含繁殖品级(蚁后/雄蚁)与劳力品级(工蚁),后者分化出无性繁殖等特化形态 [2] - 单蚁后巢穴与多蚁后共存形态并存,部分物种工蚁完全取代蚁后功能 [2] 社会分工的遗传机制 - 蚂蚁基因组中970个基因簇在1.57亿年里保持稳定,参与调控发育和代谢等基础生命过程 [3] - 工蚁亚品级分化(如兵蚁)与关键基因表达差异相关,例如gcm基因影响神经胶质功能特化 [5] - 群体规模扩大驱动社会复杂度升级,保幼激素调控及脑发育基因差异是分子基础 [5] 社会性特征的协同演化 - 蚂蚁演化出种植真菌、放牧蚜虫、社会性寄生等模块化生存策略 [6] - 性状协同演化(如放牧蚜虫+大巢穴+多蚁后)增加社会组织复杂度 [6] - 基因选择压力动态变化(强化/放松)推动不同物种社会结构多样性 [6] 研究意义与理论框架 - 多层次演化机制(基因/个体/群体)为理解社会性动物提供理论模型 [7] - "旧基因,新功能"策略体现生命演化的简约性,核心调控网络重塑是关键 [7]
蚂蚁社会性演化之谜被揭示
环球网资讯· 2025-06-17 10:35
蚂蚁演化与社会性研究 - 中外联合研究项目揭示了蚂蚁从独居物种演化为拥有1 5万多个物种的庞大生物类群的过程 并解析了推动其社会分工和组织结构演化的关键基因 [1] - 蚂蚁社会存在两个基本品级:生殖品级(具繁殖能力)和劳力品级(工蚁无繁殖能力) 生殖分工构成其社会基础并推动社会性演化 [1] - 蚂蚁在1 57亿年演化中发展出标记觅食路径、交哺行为及种植真菌、放牧蚜虫等生存策略 形成模块化动态组合系统以适应环境需求 [2] 基因与性状协同演化机制 - 基因层面选择压力变化导致部分基因被"强化"或"放松" 体现性状间共享的基因调控基础 [2] - 社会组织形式变化是蚂蚁辐射性物种爆发和环境适应力的关键推动力 关键基因重塑社会分工与复杂度 [3] - 表型性状通过基因网络模块重塑协同演化 最终促进蚂蚁物种和社会性状多样化 [3] 研究团队与成果发表 - 研究由浙江大学生命演化研究中心、中国科学院昆明动物研究所等机构合作完成 成果发表于《细胞》期刊 [1][2][3] - 论文共同作者包括博士后丁果、客座学者冉浩及副研究员刘薇薇 项目发起人为教授张国捷 [1][2][3]
合成“基因开关”能调控植物遗传特性 有助发展按需设计的智能农业
科技日报· 2025-06-11 07:33
技术突破 - 美国科罗拉多州立大学团队成功合成"基因开关",首次实现灵活调控成熟植物关键遗传特性 [1] - 该技术通过构建新型DNA片段植入植物体内,使生物体具备类似电子电路的开关功能,可精确控制特定基因表达 [1] - 研究突破此前仅限单细胞生物的基因调控技术瓶颈,攻克多细胞植物因组织结构复杂带来的应用挑战 [1] 研发方法 - 团队合成植物DNA片段并构建遗传"切换系统",结合数学建模筛选最优设计方案 [1] - 选定DNA序列导入植物后,通过12天持续监测定量评估基因表达调控效果 [1] 应用前景 - 技术实现植物基因功能的可预测、可编程调控,为智能农业提供理论基础 [2] - "基因电路"可调控植物生命周期各阶段活动,例如增强作物抗旱能力或缩短生长周期 [2] - 未来结合机器学习可优化设计流程,加速自动化研发进程 [2] 行业影响 - 技术将推动农业领域按需设计作物功能,如调控南瓜生长周期同时保持产量与营养 [2] - 突破性进展为粮食安全、环境修复及可持续材料开发开辟新路径 [2]