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空间转录组学
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《Nature》重磅发布:脂肪的“记忆”与“遗忘”:新研究揭秘减重如何逆转衰老的细胞机制
GLP1减重宝典· 2025-09-26 21:05
研究设计与人群概况 - 研究结合单核RNA测序和空间转录组学两项前沿技术,对脂肪组织进行细胞层面的精准分析,相当于对城市居民进行"入户普查"并配备"高清卫星地图"[7] - 研究纳入三组人群:24名健康瘦体型者(LN组)以及25名减肥手术前后的肥胖受试者(OB组和WL组),实现横向比较肥胖与健康及纵向追踪减肥前后变化[8] - 减肥手术使肥胖者体重指数(BMI)从平均45.2降至35.2,空腹胰岛素和胰岛素抵抗指数显著改善,共剖析70人、逾17万个细胞,识别出20余种不同细胞状态[8] 肥胖状态下脂肪组织细胞构成变化 - 健康瘦人脂肪组织中细胞分工明确,而肥胖人群免疫细胞尤其是巨噬细胞数量激增,占比从瘦人的14%飙升至31%,成熟脂肪细胞比例下降[8][9] - 巨噬细胞主力为脂质相关巨噬细胞(LAMs),分为适应性LAMs(LAM ST1)和炎症性LAMs(LAM ST2),后者数量与个体胰岛素抵抗水平正相关[9] - 对超过4.4万个成熟脂肪细胞分析显示,肥胖组织中"压力型"脂肪细胞(AD3)和"纤维化型"脂肪细胞(AD6)激增,是脂肪组织功能衰竭的直接证据[10] 减肥后脂肪组织细胞层面变化 - 减肥后巨噬细胞总数明显减少,但炎症性LAMs的"本性"未彻底改变,留下肥胖时期"记忆",为肥胖反弹和代谢恶化提供细胞生物学解释[9] - "压力型"脂肪细胞比例从55%骤降至14,减肥后脂肪细胞同时启动脂解和脂肪合成两条代谢通路,形成"无效循环"的自我保护机制[10] - 减肥实现"僵尸大扫除"——p21阳性衰老细胞几乎被清除,SASP因子表达显著下降,是一场细胞层面的"抗衰老"革命[11] 脂肪组织微环境与空间结构 - 空间转录组学揭示肥胖脂肪组织中存在"压力微环境",成员包括压力型脂肪细胞、衰老祖细胞、炎症性巨噬细胞和压力型血管细胞,通过THBS1、TGFβ等信号分子形成恶性循环[12] - 减肥重塑"居民"构成并改变"交流内容",削弱压力和炎症信号,增强修复和稳态信号,必须从"生态系统"层面整体把握脂肪组织障碍[12] 研究启示与未来方向 - 减肥是深层次组织再生和抗衰老过程,系统性清除衰老细胞、恢复组织健康,未来干预有望突破"能量负平衡"模式[13] - 免疫细胞的"记忆"提醒预防远比治疗更重要,未来可能发展清除衰老细胞药物或"再教育"免疫细胞新疗法[13] - 研究为未来治疗策略提供"藏宝图",标注脂肪组织功能障碍的关键细胞、信号通路和调控因子[13]
东南大学/华大合作发表最新Cell论文:实现器官发生早期完整胚胎的数字重建
生物世界· 2025-06-19 11:07
胚胎发育研究 - 胚胎发育包含一系列错综复杂且分层次的细胞命运转变,包括胚层形成以及随后的器官发生[1] - 哺乳动物胚胎发育过程中,由原肠胚形成而来的三个胚层(外胚层、中胚层和内胚层)相互协作启动器官原基的形成[1] - 早期器官发生阶段为器官形成奠定基础蓝图,具有广泛的细胞命运程序化指定事件和对发育干扰的高度敏感性[1] 最新研究成果 - 研究团队在Cell期刊发表题为"Digital reconstruction of full embryos during early mouse organogenesis"的论文[2] - 该研究在器官发生早期(E7.5-E8.0)以单细胞分辨率重建了完整的3D"数字胚胎"[2] - 研究为早期器官形成提供重要见解,也为研究发育和疾病提供独特空间平台[2] 早期器官发生特点 - 胚胎发育约第7.5天时,小鼠胚胎经历首次重大形态转变,出现心管、原始肠管和头部褶皱等关键结构[4] - 此阶段胚胎从数百个细胞迅速增殖到数万个细胞[4] - 器官形成过程依赖细胞的精确迁移、定位和分化,受时空基因表达模式和复杂信号通路严格调控[4] 研究方法与技术 - 研究团队将空间转录组学方法Stereo-seq与细胞分割技术相结合[6] - 对6个处于器官发生早期的胚胎的285个连续切片进行分析[6] - 生成器官发生早期整个胚胎的空间转录组图谱,分辨率达到单细胞水平[6] 研究成果应用 - 开发可视化平台SEU-3D重建3D"数字胚胎",精确反映原生胚胎环境中的基因表达模式和细胞状态[7] - 绘制内胚层和中胚层衍生物的空间细胞图谱,揭示复杂的跨胚层和细胞类型的信号网络[8] - 在E7.75的胚胎-胚外界面前部确定一个原基决定区(PDZ),揭示心脏原基形成过程中的协调信号交流[8]
细胞新图谱揭示关键DNA对癌症进化的作用
环球网资讯· 2025-06-19 10:47
核心观点 - 美国希望之城国家医疗中心首次揭示了染色体外DNA(ecDNA)在癌症进化中的关键作用,为精准医疗发展奠定重要基础 [1] - ecDNA的环状结构违反传统生物学规律,成为驱动癌症发生与演化的强大引擎 [1] - 研究发现ecDNA与致癌因子共同存在时会引发肿瘤微环境缺氧状态,这与癌症进展、治疗耐药性及临床不良预后密切相关 [1] 研究方法 - 结合空间转录组学和基因组数据,成功识别出源自同一祖先但获得额外突变的不同细胞群落 [2] - 通过批量RNA测序、肿瘤/正常DNA测序及空间转录组学分析,识别出肿瘤微环境中的共性特征与独特模式 [2] - 构建了可供其他科研团队参考的整合分析框架 [2] 技术应用 - 空间转录组学方法和基因组测序技术未来有望广泛应用于各类癌症的个体化治疗 [2] - 研究成果为精准医疗研究提供了坚实数据支撑,推动创新技术应用以实现更优疗效、更低副作用的治疗目标 [2] 临床意义 - 理解ecDNA在可遗传与非遗传细胞附近的分子行为有助于揭示潜在治疗靶点 [2] - 研究成果可评估癌症复发风险 [2] - 有望为癌症患者提供更个性化、更具针对性的治疗方案 [1]