多组学

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痛经药物的春天还要再等等
36氪· 2025-07-08 07:11
子宫内膜异位症治疗市场现状 - 全球约1.9亿育龄女性受子宫内膜异位症影响,其中90%患者经历盆腔疼痛,26%面临不孕问题 [1] - 疾病具有高复发性和长期折磨特点,需持续治疗直至绝经才能缓解 [1] - 当前治疗以NSAIDs(如布洛芬)为主,但仅缓解症状无法根治,且低价(几美元/瓶)抬高新药准入门槛 [2] 药物研发困境 - 致病机制未完全明确,涉及激素异常、免疫炎症等多重因素,缺乏有效动物模型和生物标志物 [2] - 患者个体差异大,疾病分型无共识,导致新机制药物转化率长期低迷 [2] - 现有获批药物(如艾伯维Orilissa、辉瑞Myfembree)存在高价(1000美元/月)、骨密度降低等副作用问题 [3] - 拜耳Visanne(2010年获批)虽耐受性较好但销售未达预期,联合疗法项目已中止 [3][4] Organon研发挫折 - 公司2021年收购Forendo Pharma获得OG-6219,支付7500万美元预付款+900万美元债务+最高9亿美元里程碑款 [6] - OG-6219为口服HSD17B1抑制剂,通过组织选择性抑制雌激素活性避免全身副作用 [6] - II期试验未达主要终点(盆腔疼痛改善vs安慰剂),项目终止开发 [7] - 公司女性健康管线仅剩2个临床前项目(多囊卵巢综合征和非激素避孕),短期内难补缺口 [7] 行业创新动态 - 当前在研项目仍集中于PR/GnRH通路,但出现新探索方向:内源性大麻素通路(Gynica)、CBD类化合物(Ananda Pharma)、炎症反应(FimmCyte) [11] - 国内研究聚焦CGRP/TAM/CSF1R/NTRK靶点及中药(如散结镇痛胶囊),但多处于临床前阶段 [11] - 行业需突破性技术(基因编辑/AI药物发现/多组学)和持续资源投入才能改写治疗格局 [11][12]
柑橘为什么越来越好吃(唠“科”)
人民日报· 2025-07-05 05:56
柑橘育种技术进步 - 市场上鲜食柑橘品种丰富,包括蜜橘、沙糖橘、沃柑、脆蜜金橘、爱媛橙等,品种特性多样,如易剥皮、香味浓郁等,且育种方向从单纯追求甜度转向兼顾风味与营养[2] - 传统育种流程包括优势产区选种、亲本授粉杂交、后代性状评价筛选、新品种比较试验和区域试验,周期长且工作量大[2] - 现代杂交育种采用胚芽嫁接技术,将新品种开花结果时间缩短至3-5年,显著提升育种效率[2] 基因组技术与"液相芯片"应用 - 通过全基因组重测序技术,公司筛选出300多个代表性柑橘种质资源和4万多个核心位点,研发出全球首个柑橘全基因组"液相芯片"[2] - "液相芯片"通过基因位点吸附特定颜色"魔法珠子",利用光学信号分析柑橘样本特性,可预测杂交后代性状并快速识别目标材料[3] - 该技术为杂交育种提供精准导航,大幅提升育种定向性和效率[3] 基因编辑技术发展 - 采用CRISPR-Cas9系统实现基因片段精准编辑,可删除不良基因或插入优良基因,培育抗病、高甜度、多汁、高维生素等复合优点的品种[3][4] - 当前基因编辑品种仍处于实验室阶段,尚未具备市场化条件[4] 行业未来展望 - 新技术将持续推动柑橘品种迭代,未来将出现更多兼具美味与健康特性的新品种[5]
海南大学发表最新Nature论文
生物世界· 2025-07-03 07:15
研究背景 - 以连接组和空间转录组为代表的多组学研究已进入单细胞分辨率时代,需要具备单细胞水平空间定位能力的参考脑图谱 [2] - 现有的脑图谱未能实现单细胞可见的空间定位 [2] 研究成果 - 骆清铭院士、龚辉教授及董红卫教授团队合作在Nature发表研究论文,以1微米各向同性分辨率绘制小鼠三维脑区和立体定位图谱 [3] - 研究团队通过连续微光学切片断层成像技术,呈现了基于尼氏染色的小鼠全脑细胞结构数据集 [6] - 构建了小鼠大脑三维参考图谱STAM,提供916个结构的三维形貌,可生成任意角度的1微米分辨率切片图像 [6] 技术应用 - 开发基于信息学的平台,用于可视化和共享图谱图像,提供脑切片配准、神经元回路绘制和智能立体定向手术规划等服务 [6] - 该图谱可与广泛使用的立体定位图谱兼容,支持二维和三维空间中的跨图谱导航与映射 [6] - STAM图谱有望成为多功能脑科学工具,支持在单细胞水平上研究整个大脑 [8]
华大×南方科技大学合作发表最新Cell论文:解码生命动态调控“时空密码”
生物世界· 2025-06-26 21:35
研究背景与核心成果 - 研究团队通过华大时空组学技术Stereo-seq及单细胞组学技术,创建了果蝇全发育周期的3D单细胞时空多组学图谱,解析了细胞类型分化的时空动态与核心调控网络[2][3][4] - 该成果为发育生物学提供了分子层面参考,并为发育缺陷及相关疾病机制研究奠定基础[4] 技术方法与数据规模 - 采用Stereo-seq技术搭配scRNA-seq和scATAC-seq,对果蝇胚胎每0.5-2小时及幼虫、蛹期关键阶段采样,生成超过380万个空间分辨的单细胞转录组[7] - 利用Spateo算法重建高精度3D模型,精准解析组织形态与基因表达的空间动态[7] 细胞分化与调控机制 - 构建果蝇胚胎发育的"分化轨迹地图",发现不同胚层细胞沿特定路径分化,转录因子如新鉴定的CG42394和lncRNA:CR30009在神经、肠道等系统中起关键作用[9][14] - 果蝇与人类共享约70%疾病相关基因,其发育机制研究可为人类发育疾病提供参考[9] 组织分化空间模式 - 脂肪体分化呈分散式模式,细胞类型空间混合分布;前/后肠分化呈中心化特征,细胞按发育阶段聚集[13] - 中枢神经系统发育中,神经索后端与脑部前端在不同阶段主导形态变化,新发现跨膜蛋白和lncRNA参与神经母细胞迁移[14] 中肠发育动态与功能分区 - 幼虫期中肠干细胞已呈现区域特异性基因表达差异,为成虫期细胞再生奠定基础[18] - 胚胎期启动功能分区,幼虫期细胞类型多样化且与成虫阶段高度相似,蛹期分化为内外两层结构承担不同功能[19] - 发现转录因子exex调控中肠铜细胞发育,敲降exex导致铜细胞数量锐减及功能异常[22][24] 研究意义与团队贡献 - 该研究首次实现单细胞分辨率的果蝇全发育周期3D多组学图谱,为动物发育机制提供全新见解[25] - 华大生命科学研究院与南方科技大学团队通过多组学技术交叉融合,建立发育研究的参考范式[25]
长期规律运动可延缓衰老!我国科学家揭示其中的分子机制
央视新闻· 2025-06-26 04:56
运动与衰老机制研究 - 研究团队首次系统解析人体对急性单次运动与长期规律运动的分子-细胞动态响应谱,揭示肾脏是运动效应的关键应答器官 [1] - 研究发现肾脏内源代谢物甜菜碱作为衰老延缓的核心分子信使,通过靶向抑制天然免疫枢纽激酶TBK1,协同阻遏炎症并缓解多器官衰老进程 [1] - 研究成果发表于国际学术期刊《细胞》,历时六年完成 [1] 运动适应性反应机制 - 研究首次将运动适应性反应解构为可量化的多组学动态网络,系统解析单次急性运动与长期规律运动后的生理适应表现与机制 [4] - 发现急性运动激发"生存应激型"代谢风暴与氧化损伤,而长期运动驱动健康导向的代谢-免疫稳态重塑 [4] - 长期运动建立以代谢重编程、免疫年轻化、表观遗传维稳及抗氧化能力提升为支柱的多维适应体系 [4] - 长期运动同步重塑肠道菌群结构,抑制病原共生菌丰度,协同调控机体能量代谢 [4] 甜菜碱的抗衰老功效 - 研究发现长期运动可显著上调肾脏甜菜碱水平 [5] - 老年小鼠口服甜菜碱实验显示其延长健康寿命并显著改善五大功能指标:代谢能力增强、肾功能提升、运动协调性改善、抑郁样行为减少及认知功能提高 [5] - 病理组织学与单细胞转录组分析证实甜菜碱具有延缓多器官衰老的功效,尤以肾脏与骨骼肌为著 [5] - 口服甜菜碱有效降低老年小鼠肝脏脂肪化 [5]
因美纳3.5亿美元布局蛋白质组学领域
国际金融报· 2025-06-24 18:14
收购交易 - 公司宣布以3.5亿美元现金收购蛋白质组学技术企业SomaLogic及其他指定资产,交易含高达7500万美元的绩效里程碑款项及业绩相关版税 [1] - 交易预计2026年上半年完成,需满足监管审批等交割条件,双方目前保持独立运营 [4] - 此次收购建立在2021年12月双方共同开发协议基础上,旨在整合SomaScan®检测技术与公司NGS平台 [3] 战略布局 - 收购将强化公司在蛋白质组学市场的布局,推进2024年提出的多组学战略,提升NovaSeq X产品价值 [3] - 整合SomaLogic技术后,结合公司NGS平台、DRAGEN™软件及Connected Multiomics,可加速蛋白质组学技术发展并降低成本 [3] - 预计2025年Q3全面推出Illumina Protein Prep产品,目前已在全球近40家早期客户中试用 [3] 行业前景 - 全球蛋白质组学市场规模预计从2024年336亿美元增至2029年605亿美元,年复合增长率12.4% [9] - 蛋白质组学被视为体外诊断行业最后竞争领域,能直接反映疾病状态,在生物标志物发现、药物研发等方面起关键作用 [7] - 行业已现多起重大布局:赛默飞世尔2023年31亿美元收购Olink,Spear Bio获数千万美元种子轮融资,Alamar Biosciences完成1亿美元C轮首募 [10] 公司现状 - 公司占据全球基因测序仪超80%市场份额,但2024年营收43.72亿美元同比下滑2.9%,连续三年亏损达12.23亿美元 [6] - 面临中国市场列入不可靠实体清单、罗氏诊断/华大智造等竞争者蚕食份额等挑战,2025年4月宣布全球裁员3.5%以缩减1亿美元开支 [6] 技术协同 - 蛋白质组学可解析免疫细胞亚型功能,弥补基因测序在mRNA和蛋白质层面的应用确定性不足问题 [7] - 公司现有基因测序业务被视为"卖铲人",而蛋白质组学作为生命活动最终执行者的检测工具更具临床价值 [7] - 预计收购标的2027年实现非GAAP经营收入盈利,2028年经营利润率与公司整体持平 [10]
Illumina收购蛋白组学公司SomaLogic
仪器信息网· 2025-06-24 10:41
特别提示 微信机制调整,点击顶部"仪器信息网" → 右上方"…" → 设为 ★ 星标,否则很可能无法看到我们的推送。 圣 地 亚 哥 2025 年 6 月 23 日 , I l lumina 宣 布 已 与 Standard BioTool s ( 纳 斯 达 克 股 票 代 码 : LAB) 签 署 了 一 项 最 终 协 议 , 根 据 该 协 议 , I l lumina将收购数据驱动蛋白质组学技术领导者SomaLogic和其他指定资产,收盘时需支付 3.5亿美元的现金 ,但需进行相关调整,加上 高达 7500万美元的短期基于绩效的里程碑和基于绩效的特许权使用费 。 I l lumina 首席执行官Jacob Thay sen表示, "收购SomaLogic将加强I l lumina在不断扩大的蛋白质组学市场的存在,并推动我们在2024 年宣布的多组学战略。 这将增强NovaSeq X产品今天的价值,并在未来解锁更大的功能。I l lumina和SomaLogic已经密切合作了三年多,这 种组合提高了我们为客户服务的能力,并加快了我们实现先进生物标志物检测和疾病分析的技术路线图。 " "我们正在将NGS ...
AI赋能,顶刊不愁:机器学习分析代谢组/蛋白组/宏基因/16S/网络药理学/转录组
生物世界· 2025-06-11 12:01
课程核心内容 - 零基础R语言编程从入门到实战 快速打造生信分析基本功 [1] - AI赋能+CNS文献精读 拆解多组学科研经典范式与创新思路 [1] - 全面覆盖代谢组 蛋白组 微生物组 转录组等热门方向 [1] - 集成xgboost lasso 随机森林等多种机器学习模型 打造智能化分析能力 [3] - 每节课精选CNS文章源代码 手把手复现高水平研究 [3] - 独家一对一指导+包教包会教学模式 [3] - 直播授课+课后录屏 搭配完整资料包 [3] - 课后持续答疑服务 课程结束答疑不结束 [3] 课程模块设计 AI+多组学论文解读 - Deepseek高效阅读多组学CNS生信文章 [2] - AI整理代谢组 蛋白组 宏基因组数据分析流程 [2] - 从文献中快速总结多组学数据分析方法 [2] - 评价文章思路创新性和数据分析可行性 [2] 多组学课题设计 - Deepseek辅助代谢组 蛋白组 宏基因组联合分析策略 [2] - AI指导多组学交叉验证思路 [2] - 汇总生信论文模板设计要点 [2] - 构建公共数据库联合验证策略 [2] 编程基础 - R和Rstudio安装与环境配置 [2] - R语言语法及常见命令 [2] - 以Cell/Nature文章学习R包安装与使用 [2] - 向量 矩阵 数据框和列表的创建与索引 [2] - 自定义Function函数构建 [2] - 云服务器使用方法 [2] 机器学习组学分析 代谢组学 - 三大代谢物库:HMDB METLIN KEGG [4] - 无监督式机器学习应用 [4] - 三种回归分析:线性 Logistic Cox [4] - PLS-DA算法:决策树 随机森林 贝叶斯网络 [4] - Nature子刊源代码复现 [4] 蛋白组学 - 无监督聚一致性聚类 [4] - PPI蛋白互作网络构建 [4] - 通路富集网络构建 [4] - WGCNA加权基因共表达网络 [4] - Nature Medicine源代码复现 [4] 宏基因组 - 物种相关性网络分析 [6] - Alpha/Beta多样性分析 [6] - 随机森林筛选群落Biomarker [6] - Science文章源代码复现 [6] 转录组 - 随机效应模型差异基因meta分析 [12] - 转录因子富集构建调控网络 [12] - GSEA GSVA富集分析 [12] - CIBERSORT免疫浸润 [12] - CELL主刊源代码复现 [12] 多组学联合分析 - 主成分分析代谢组学和蛋白组学变量差异 [14] - 共表达网络和调控网络探索多组学数据 [14] - 多组学3D数据可视化 [14] - Metscape使用 [14] - 多组学联合分析三维多层网络 [14] - Nature Aging源代码复现 [14] 教学团队 - 主讲老师华哥 中山大学博士 东京大学医学人工智能研究员 [16] - 深耕单细胞多组学与机器学习6年 培养学员3万余人 [16] - 指导学员发表CNS主刊8篇 一区及子刊90余篇 [16] - 参与国自然重点 国家重大专项等项目申报 [16] - 发表SCI论文21篇 包括PNAS Cell Rep Med等顶刊 [16] 教学成果 - 学员发表Cell Nature Science主刊10篇 子刊及一区90余篇 [20] - 深入剖析20多篇CNS文章分析思路和方法 [22] - 中国抗癌协会肿瘤标志物学术大会开设培训专场 [23] - 广东省生信学会年会设立培训专场 [26] - 广东省中医院举办生物信息学理论培训班 [29] 课程服务 - 配备往期视频预习 免费再学机会 [32] - 课后一对一指导服务 解决所有问题 [33] - 指导无时间限制 课程结束答疑不结束 [33] - 六年前老学员仍保持联系 [33] 课程安排 - 线上线下结合 腾讯会议直播 广州线下举办 [34] - 每批只招30人 保证培训质量 [34] - 主办单位:华哥生信科研平台 [34] - 承办单位:广州百奥信息科技 广州华哥信息科技 [34]
灵敏度提升10倍!SCIEX发布旗舰新品:ZenoTOF8600极速超敏多重碎裂高分辨质谱系统
仪器信息网· 2025-06-04 17:01
产品发布 - 公司于2025年6月2日在ASMS年会上正式推出ZenoTOF 8600系统,该产品为高分辨质谱领域树立新标杆,显著提升复杂结构解析能力和物质定量效率 [3] - 新系统整合三重四极杆创新技术,核心突破包括OptiFlow Pro离子源、DJet离子导入和双频QJet离子导向器,灵敏度较前代提升10倍 [4] - 搭载Mass Guard技术和新型光学检测器,支持高离子电流下的高效运行 [5][6] 技术升级 - ZT Scan DIA 2.0模式升级数据非依赖性采集技术,实现更广质量范围和更快扫描速度,推动多组学研究从定性到定量的跨越 [7] - 系统在实际应用中鉴定率提升30%-40%,支持自定义单位分辨率扫描窗口,显著增强脂质分析能力 [9] - 配套SCIEX OS 4.0软件通过自动化流程和加速运算提升操作效率,优化智能工作流程 [10] 生态合作 - 公司与MS-DIAL平台合作,支持多扫描模式原始数据处理,并针对ZT Scan DIA优化数据分析流程 [11] - 与Bioinformatics Solutions Inc合作推出PEAKS 13软件,优化蛋白质组学数据处理,提升变异系数控制和运算速度 [11] 行业影响 - 新技术预计在多组学领域产生深远影响,客户反馈显示新数据将推动实际科研成果转化 [13] - 公司拥有50年质谱技术创新经验,持续开发稳健解决方案以改善人类健康和安全 [15]
新股消息 | 安诺优达拟港股IPO 中国证监会要求说明公司注销浙江安诺优达、安维康科技、义乌检验所的原因及办理进展
智通财经网· 2025-05-30 20:59
智通财经APP获悉,5月30日,中国证监会公布境外发行上市备案补充材料要求公示(2025年5月23日— 2025年5月29日)。中国证监会要求安诺优达基因科技(北京)股份有限公司(简称:安诺优达)说明公司注 销浙江安诺优达、安维康科技、义乌检验所的原因及办理进展及开展IVD检测试剂盒、测序仪及生物信 息学分析软件以及配套技术支持及实验室设计服务等业务取得资质许可的情况等。据港交所3月25日披 露,安诺优达向港交所主板提交上市申请,建银国际、国泰君安国际为其联席保荐人。 中国证监会请公司补充说明以下事项,并请律师进行核查并出具明确的法律意见: 一、请说明公司注销浙江安诺优达、安维康科技、义乌检验所的原因及办理进展,是否对公司业务构成 重大不利影响。 二、请具体说明员工持股计划的人员构成,夏佐全通过其控制的时丰华富向李志民授予股权激励份额是 否已履行必要的决策程序,并就员工持股计划的价格公允性、规范运行情况及其实施是否合法合规出具 明确结论性意见。 三、请说明开展IVD检测试剂盒、测序仪及生物信息学分析软件以及配套技术支持及实验室设计服务等 业务取得资质许可的情况。 四、请说明公司前期通过北京医检所、义乌检验所、 ...